RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262605.8

TTPAL-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-201ENST00000262605 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP11.98□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 PDE6AP16499 860 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 TBC1D9BQ66K14 1250 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 FMN2Q9NZ56 1722 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 CEP131Q9UPN4 1083 aa11.98□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 SERPINC1P01008 464 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 KRT18P05783 430 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 PIK3C2AO00443 1686 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 KIF5BP33176 963 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 TEX11Q8IYF3 940 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 CEP57L1Q8IYX8 460 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 CERKQ8TCT0 537 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 EIF6P56537 245 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 VEZTQ9HBM0 779 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 TPCN1Q9ULQ1 816 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 DSCC1Q9BVC3 393 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF76P36508 570 aa11.97□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 RXRBP28702 533 aa11.96□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 DOK7Q18PE1 504 aa11.96□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa11.96□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa11.96□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa11.96□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
TTPAL-201ENST00000262605 AKAP12Q02952 1782 aa11.96□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa11.96□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 H0YIN7 160 aa11.96□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 FAM47AQ5JRC9 791 aa11.96□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 CDC37L1Q7L3B6 337 aa11.96□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 PHKBQ93100 1093 aa11.96□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 CPDO75976 1380 aa11.96□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 JCADQ9P266 1359 aa11.96□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 MAST3O60307 1309 aa11.96□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 FGAP02671 866 aa11.96□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 SERPINB2P05120 415 aa11.96□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 ATP10DQ9P241 1426 aa11.95□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa11.95□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 ISCA1Q9BUE6 129 aa11.95□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 GTF2IP78347 998 aa11.95□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 USP25Q9UHP3 1055 aa11.95□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 MTX1Q13505 466 aa11.95□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 FAM43AQ8N2R8 423 aa11.95□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 PEAK1Q9H792 1746 aa11.95□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 PDE4CQ08493 712 aa11.95□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 KLHL10Q6JEL2 608 aa11.95□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 TMTC2Q8N394 836 aa11.95□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 MAP4K1Q92918 833 aa11.95□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 NALCNQ8IZF0 1738 aa11.94□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF804BA4D1E1 1349 aa11.94□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa11.94□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa11.94□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 OSBP2Q969R2 916 aa11.94□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 EYA3Q99504 573 aa11.94□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa11.94□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 GPR108Q9NPR9 543 aa11.94□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa11.94□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 IFNL3Q8IZI9 196 aa11.94□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 CNNM3Q8NE01 707 aa11.94□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 KIF1AQ12756 1690 aa11.94□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 CHGBP05060 677 aa11.94□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 MCAMP43121 646 aa11.94□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 LINC00116Q8NCU8 138 aa11.94□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 TCP10Q12799 353 aa11.94□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 ITPK1Q13572 414 aa11.94□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 PRKAB2O43741 272 aa11.93□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 DACT1Q9NYF0 836 aa11.93□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 RTL9Q8NET4 1388 aa11.93□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 PPARAQ07869 468 aa11.93□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 WDR66Q8TBY9 1149 aa11.93□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 CYP21A2P08686 494 aa11.93□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 SCNN1DP51172 638 aa11.93□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 RPS6KA4O75676 772 aa11.93□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 VPS72Q15906 364 aa11.93□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 C2CD5Q86YS7 1000 aa11.93□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 MFSD14BQ5SR56 506 aa11.92□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 OGFOD1Q8N543 542 aa11.92□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 FEZ1Q99689 392 aa11.92□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 CABP5Q9NP86 173 aa11.92□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 POLD1P28340 1107 aa11.92□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 RASGRF1Q13972 1273 aa11.92□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 PXDNLA1KZ92 1463 aa11.92□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa11.92□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 LARGE1O95461 756 aa11.92□□□□□ -0.5
TTPAL-201ENST00000262605 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms