RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261799.8

PDGFRB-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRB, Length 5,717 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-201ENST00000261799 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
PDGFRB-201ENST00000261799 A0A1B0GUL7 405 aa15.39■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 TRIM75PA6NK02 468 aa15.39■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 TCP10L2B9ZVM9 353 aa15.39■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 TAF5LO75529 589 aa15.39■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 RPS8P62241 208 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 PNMA2Q9UL42 364 aa15.39■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 MAGI2Q86UL8 1455 aa15.39■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 SPAG5Q96R06 1193 aa15.39■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 NLRP1Q9C000 1473 aa15.39■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 BMP2KLQ5H9B9 411 aa15.39■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 NSMFQ6X4W1 530 aa15.39■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 CPXCR1Q8N123 301 aa15.39■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 TAF3Q5VWG9 929 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 CPLX3Q8WVH0 158 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 FNBP1Q96RU3 617 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 MAPKBP1O60336 1514 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 DISP1Q96F81 1524 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 RAD50Q92878 1312 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 CHMP2AO43633 222 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 AKNAD1Q5T1N1 836 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 KCNG4Q8TDN1 519 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 DYDC1Q8WWB3 177 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 MCM3P25205 808 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 LTKP29376 864 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 SYKP43405 635 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 AFMP43652 599 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 BIRC2Q13490 618 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 WDR44Q5JSH3 913 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 LEKR1Q6ZMV7 388 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 LRRC2Q9BYS8 371 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 RSPH6AQ9H0K4 717 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 PODXL2Q9NZ53 605 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 PLXNC1O60486 1568 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 SSFA2P28290 1259 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 MCM7P33993 719 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 DNA2P51530 1060 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 CHURC1Q8WUH1 139 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 NACA2Q9H009 215 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 USPL1Q5W0Q7 1092 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 SPATA5Q8NB90 893 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 GINS2Q9Y248 185 aa15.38■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 PRPHP41219 470 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 PDE1AP54750 535 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 SNX16P57768 344 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 CCDC113Q9H0I3 377 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 KDM6BO15054 1643 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 HARSP12081 509 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 MFSD14BQ5SR56 506 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 HAUS3Q68CZ6 603 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 CCDC169A6NNP5 214 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 PSMA7O14818 248 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 CTSWP56202 376 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 IFFO1Q0D2I5 559 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 DOK7Q18PE1 504 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 CCDC93Q567U6 631 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 RNF34Q969K3 372 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 CTAGE1Q96RT6 745 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 LZTS2Q9BRK4 669 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 KIFC2Q96AC6 838 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 CARD10Q9BWT7 1032 aa15.37■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 PHKG2P15735 406 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 SDSP20132 328 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 GNPTABQ3T906 1256 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 DTHD1Q6ZMT9 781 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 BICDL2A1A5D9 508 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 PPFIA3O75145 1194 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 NUCB1Q02818 461 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 TNNI3KQ59H18 835 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 IKBKGQ9Y6K9 419 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 SIK1P57059 783 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 TRPC3Q13507 836 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 NCAPG2Q86XI2 1143 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 GBP3Q9H0R5 595 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 PLEKHG3A1L390 1219 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 CCDC65Q8IXS2 484 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 BACH2Q9BYV9 841 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 LGR6Q9HBX8 967 aa15.36■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 MLXIPQ9HAP2 919 aa15.35■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 ADCY7P51828 1080 aa15.35■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 MLH3Q9UHC1 1453 aa15.35■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa15.35■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 KIAA0754O94854 1291 aa15.35■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 RPL13P26373 211 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms