RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
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CTIF-201ENST00000256413 RABGGTAQ92696 567 aa18.03■□□□□ 0.48
CTIF-201ENST00000256413 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa18.03■□□□□ 0.48
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CTIF-201ENST00000256413 MYO1CO00159 1063 aa18.03■□□□□ 0.48
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CTIF-201ENST00000256413 C8orf58Q8NAV2 365 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-201ENST00000256413 STAG1Q8WVM7 1258 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-201ENST00000256413 SLF1Q9BQI6 1058 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-201ENST00000256413 PLCB1Q9NQ66 1216 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-201ENST00000256413 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-201ENST00000256413 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa17.99■□□□□ 0.47
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CTIF-201ENST00000256413 ATP2B3Q16720 1220 aa17.99■□□□□ 0.47
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CTIF-201ENST00000256413 KRT9P35527 623 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-201ENST00000256413 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP17.99■□□□□ 0.47
CTIF-201ENST00000256413 SYNJ2O15056 1496 aa17.99■□□□□ 0.47
CTIF-201ENST00000256413 CLTAP09496 248 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-201ENST00000256413 RASSF2P50749 326 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-201ENST00000256413 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
CTIF-201ENST00000256413 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.479e-61■■■■■ 50.8
CTIF-201ENST00000256413 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
CTIF-201ENST00000256413 ANO1Q5XXA6 986 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-201ENST00000256413 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
CTIF-201ENST00000256413 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
CTIF-201ENST00000256413 KRT23Q9C075 422 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-201ENST00000256413 ZNF202O95125 648 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-201ENST00000256413 MAP7D1Q3KQU3 841 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-201ENST00000256413 KCNH3Q9ULD8 1083 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-201ENST00000256413 CFAP221Q4G0U5 840 aa17.98■□□□□ 0.47
CTIF-201ENST00000256413 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa17.98■□□□□ 0.47
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