RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253754.7

PDLIM4-201, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDLIM4, Length 2,282 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-201ENST00000253754 USP25Q9UHP3 1055 aa22■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.99■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 GUCY1B3Q02153 619 aa21.99■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 TXNRD1Q16881 649 aa21.99■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 PGBD1Q96JS3 809 aa21.99■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 LRP5O75197 1615 aa21.99■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.99■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 PRC1O43663 620 aa21.99■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 FGFR2P21802 821 aa21.99■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 ANTXR2P58335 489 aa21.99■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 LPIN2Q92539 896 aa21.99■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 NBPF3Q9H094 633 aa21.99■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 C4AP0C0L4 1744 aa21.98■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 HS1BP3Q53T59 392 aa21.98■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 DACT1Q9NYF0 836 aa21.98■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 MROH5Q6ZUA9 1318 aa21.98■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.97■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF213O14771 459 aa21.97■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 PDE6AP16499 860 aa21.97■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.96■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 MPNDQ8N594 471 aa21.96■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.96■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 NYXQ9GZU5 481 aa21.96■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.96■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.96■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 ADRA2BP18089 450 aa21.96■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 MCM5P33992 734 aa21.96■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.96■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 LAMB2P55268 1798 aa21.96■■□□□ 1.11
PDLIM4-201ENST00000253754 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.95■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 APPP05067 770 aa21.95■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 RASGRF1Q13972 1273 aa21.95■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.95■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 CKAP2LQ8IYA6 745 aa21.95■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.95■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 NCOA7Q8NI08 942 aa21.95■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.95■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 MYH7P12883 1935 aa21.95■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.95■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 EVCP57679 992 aa21.95■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.95■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 FBXL16Q8N461 479 aa21.95■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 BICD2Q8TD16 824 aa21.95■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.94■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 NR1I2O75469 434 aa21.94■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 UBE3CQ15386 1083 aa21.94■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 UVSSAQ2YD98 709 aa21.94■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 SPATA5Q8NB90 893 aa21.94■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.94■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.94■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC5A1P13866 664 aa21.94■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.94■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 PLSCR1O15162 318 aa21.93■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 NPHP1O15259 732 aa21.93■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 MAP3K11Q16584 847 aa21.93■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 CCDC39Q9UFE4 941 aa21.93■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 RTL9Q8NET4 1388 aa21.93■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.92■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 COL4A1P02462 1669 aa21.92■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 ADCY5O95622 1261 aa21.92■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 BCAMP50895 628 aa21.92■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 NFIXQ14938 502 aa21.92■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 MAGEB6Q8N7X4 407 aa21.92■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 TNMDQ9H2S6 317 aa21.92■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa21.92■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 AP5Z1O43299 807 aa21.91■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 CCDC192P0DO97 292 aa21.91■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 TAF1P21675 1872 aa21.91■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.91■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.91■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 USP28Q96RU2 1077 aa21.91■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 INCENPQ9NQS7 918 aa21.91■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 CFAP45Q9UL16 551 aa21.91■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 KIF3AQ9Y496 699 aa21.91■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.91■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 PLCB2Q00722 1185 aa21.91■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 AIDAQ96BJ3 306 aa21.91■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.91■■□□□ 1.1
PDLIM4-201ENST00000253754 NLRP3Q96P20 1036 aa21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62 ms