RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 MCAMP43121 646 aa23.63■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 SMTNL1A8MU46 457 aa23.62■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.62■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 PLA2G4DQ86XP0 818 aa23.62■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 RPS6KB1P23443 525 aa23.62■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 PHKA1P46020 1223 aa23.62■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 LRMPQ12912 555 aa23.62■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 TAF6LQ9Y6J9 622 aa23.62■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 FGFR2P21802 821 aa23.61■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 SCN7AQ01118 1682 aa23.61■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 SYCP1Q15431 976 aa23.61■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 CCDC102BQ68D86 513 aa23.61■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23.61■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 LPIN2Q92539 896 aa23.61■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 PROM2Q8N271 834 aa23.6■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 BICD2Q8TD16 824 aa23.6■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 TCEANC2Q96MN5 208 aa23.6■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 NRBP1Q9UHY1 535 aa23.6■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 TAF1P21675 1872 aa23.6■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 CHRNDQ07001 517 aa23.59■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 FEZ1Q99689 392 aa23.59■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 TNNT1P13805 278 aa23.59■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 ZNF165P49910 485 aa23.59■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.59■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 LRP5O75197 1615 aa23.59■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 RFX7Q2KHR2 1363 aa23.59■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 RTL9Q8NET4 1388 aa23.59■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 RGL2O15211 777 aa23.58■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.58■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 NYXQ9GZU5 481 aa23.58■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.58■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.58■■□□□ 1.37
VGF-201ENST00000249330 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 CAVIN2O95810 425 aa23.57■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 STK3Q13188 491 aa23.57■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 NFIXQ14938 502 aa23.57■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.57■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 DNAJC25Q9H1X3 360 aa23.57■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 SPEF2Q9C093 1822 aa23.57■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 NPHP1O15259 732 aa23.57■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 NR1I2O75469 434 aa23.57■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.57■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 NLRP3Q96P20 1036 aa23.57■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa23.57■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 OSBP2Q969R2 916 aa23.56■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 KIF20AO95235 890 aa23.56■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 TXNRD1Q16881 649 aa23.56■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 LAMB2P55268 1798 aa23.56■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 SLC5A1P13866 664 aa23.55■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 CDC25BP30305 580 aa23.55■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.55■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 MAST3O60307 1309 aa23.55■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 M0R2C6 588 aa23.55■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 BCAMP50895 628 aa23.55■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.55■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 CCDC112Q8NEF3 446 aa23.55■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 PGBD1Q96JS3 809 aa23.55■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 C4AP0C0L4 1744 aa23.55■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 WASHC4Q2M389 1173 aa23.54■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 OGFRQ9NZT2 677 aa23.54■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 TSGA10IPQ3SY00 556 aa23.53■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 AKAP11Q9UKA4 1901 aa23.53■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa23.53■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 KRT32Q14532 448 aa23.53■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 RESTQ13127 1097 aa23.52■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.52■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 H3BQV1 296 aa23.52■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 GYS1P13807 737 aa23.52■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 RASGRF1Q13972 1273 aa23.52■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 IFFO2Q5TF58 517 aa23.52■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 BRF1Q92994 677 aa23.52■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 GTF3C6Q969F1 213 aa23.52■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
VGF-201ENST00000249330 A0A0G2JLW4 131 aa23.51■■□□□ 1.35
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