RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246024.6

TMX4-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX4, Length 6,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4-201ENST00000246024 HSPA4P34932 840 aa15.21■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 UNC13AQ9UPW8 1703 aa15.21■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 DYNC1I1O14576 645 aa15.21■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 GAS8O95995 478 aa15.21■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 CCDC25Q86WR0 208 aa15.21■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 CARD14Q9BXL6 1004 aa15.21■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 GMNNO75496 209 aa15.2■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa15.2■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 ATRIPQ8WXE1 791 aa15.2■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 IL15P40933 162 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 GNAQP50148 359 aa15.2■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 PSMA7O14818 248 aa15.2■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 TRIM37O94972 964 aa15.2■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 FAM170AA1A519 330 aa15.19■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 MYCP01106 439 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa15.19■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 HS2ST1Q7LGA3 356 aa15.19■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 DUOX2Q9NRD8 1548 aa15.19■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 PRDM1O75626 825 aa15.19■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 DHX58Q96C10 678 aa15.19■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 CCDC114Q96M63 670 aa15.19■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 KRT79Q5XKE5 535 aa15.19■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 PKNOX2Q96KN3 472 aa15.19■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 EYA3Q99504 573 aa15.19■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 CCDC65Q8IXS2 484 aa15.19■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 TEX11Q8IYF3 940 aa15.19■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 KIFC2Q96AC6 838 aa15.19■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa15.18■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 ZNF790Q6PG37 636 aa15.18■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 FCHSD1Q86WN1 690 aa15.18■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 CHMP2AO43633 222 aa15.18■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 GABPAQ06546 454 aa15.18■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 MBD4O95243 580 aa15.18■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 ARMT1Q9H993 441 aa15.18■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 V9GYY5 206 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 BAG6P46379 1132 aa15.18■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 TMTC2Q8N394 836 aa15.18■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 NACA2Q9H009 215 aa15.18■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 CNNM2Q9H8M5 875 aa15.18■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP15.18■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 NSD2O96028 1365 aa15.18■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 KRT5P13647 590 aa15.18■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 APOBRQ0VD83 1088 aa15.18■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 BIRC3Q13489 604 aa15.18■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 CTAGE1Q96RT6 745 aa15.18■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa15.18■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 NOL3O60936 208 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 TACC1O75410 805 aa15.17■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 LMBR1Q8WVP7 490 aa15.17■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 KCNK9Q9NPC2 374 aa15.17■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 PPP1R7Q15435 360 aa15.17■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 HMG20BQ9P0W2 317 aa15.17■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 TLDC2A0PJX2 215 aa15.17■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 CTAGE15A4D2H0 777 aa15.17■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 BMP15O95972 392 aa15.17■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 CTAGE8P0CG41 777 aa15.17■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 CTAGE6Q86UF2 777 aa15.17■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 CTAGE4Q8IX94 777 aa15.17■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 PICK1Q9NRD5 415 aa15.17■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 CPA1P15085 419 aa15.17■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 PPP2R5CQ13362 524 aa15.17■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 CPXCR1Q8N123 301 aa15.17■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa15.17■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 GGA1Q9UJY5 639 aa15.17■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.17■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 KRT9P35527 623 aa15.16■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 PPP2R5DQ14738 602 aa15.16■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 DOK7Q18PE1 504 aa15.16■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 GIMAP6Q6P9H5 292 aa15.16■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 CAPZA3Q96KX2 299 aa15.16■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 MCM7P33993 719 aa15.16■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 MNAT1P51948 309 aa15.16■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 PDE1AP54750 535 aa15.16■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 SLC8A3P57103 927 aa15.16■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 RAPGEF1Q13905 1077 aa15.16■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 E7EVH7 732 aa15.16■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 LTKP29376 864 aa15.16■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 MAEAQ7L5Y9 396 aa15.16■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 TRIM7Q9C029 511 aa15.16■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 CSPG5O95196 566 aa15.15■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 INF2Q27J81 1249 aa15.15■□□□□ 0.02
TMX4-201ENST00000246024 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms