RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000075084.4

Trim58-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trim58, Length 2,192 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58-201ENSMUST00000075084 Col11a2Q64739 1736 aa21.51■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Casp12O08736 419 aa21.51■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 NapbP28663 298 aa21.51■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 IntuQ059U7 942 aa21.51■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 U2af1l4Q8BGJ9 220 aa21.51■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Mtmr3Q8K296 1196 aa21.51■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Akt1s1Q9D1F4 257 aa21.51■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 TrhQ62361 256 aa21.5■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Rbm43Q99J64 343 aa21.5■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Osbpl5Q9ER64 874 aa21.5■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Med23Q80YQ2 1367 aa21.5■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 CrcpO35427 148 aa21.5■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 LyarQ08288 388 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Lins1Q3U1D0 764 aa21.5■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Krt84Q99M73 603 aa21.5■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 ParvgQ9ERD8 331 aa21.5■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Apba2P98084 750 aa21.49■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 1700113H08RikE9Q9Q5 327 aa21.48■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Cfap73J3QPZ5 306 aa21.48■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Pde6aP27664 859 aa21.48■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 NppbP40753 121 aa21.48■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Cep63Q3UPP8 700 aa21.48■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Agtpbp1Q641K1 1218 aa21.48■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Sept9Q80UG5 583 aa21.48■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Olfm5Q8BU90 496 aa21.48■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Bicd2Q921C5 820 aa21.48■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Myh2G3UW82 1942 aa21.48■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Izumo3A6PWV3 263 aa21.48■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Slc7a3P70423 618 aa21.48■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Pold4Q9CWP8 107 aa21.48■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Cyp26a1O55127 497 aa21.47■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Slc4a4O88343 1079 aa21.47■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Prl7d1P04769 244 aa21.47■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Paxip1Q6NZQ4 1056 aa21.47■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Sh3bp5lQ99LH9 392 aa21.47■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Cfap99A0A140LIX9 648 aa21.47■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Fez1Q8K0X8 392 aa21.47■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 McamQ8R2Y2 648 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Irs4Q9Z0Y7 1216 aa21.47■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Gm20425E9Q035 978 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 SrprbP47758 269 aa21.46■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Eva1cP58659 440 aa21.46■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Arid3aQ62431 601 aa21.46■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 CpzQ8R4V4 654 aa21.46■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Gpr108Q91WD0 569 aa21.46■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 TnmdQ9EP64 317 aa21.46■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Add3Q9QYB5 706 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Myh15E9Q264 1925 aa21.46■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Stat5bP42232 786 aa21.46■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Gnat2P50149 354 aa21.46■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Rhbdl3P58873 404 aa21.46■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Siah1aP61092 282 aa21.46■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Jdp2P97875 163 aa21.46■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Ccdc174Q3U155 467 aa21.46■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Cyp24a1Q64441 514 aa21.46■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Fam170aQ66LM6 333 aa21.46■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Snx13Q6PHS6 957 aa21.46■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 DymQ8CHY3 669 aa21.46■■□□□ 1.03
Trim58-201ENSMUST00000075084 Metap2O08663 478 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 SdsQ8VBT2 327 aa21.45■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Utp3Q9JI13 469 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Cdc45Q9Z1X9 566 aa21.45■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Ccdc112A0AUP1 442 aa21.44■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Me1P06801 572 aa21.44■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Slurp2P0DP59 97 aa21.44■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Myh4Q5SX39 1939 aa21.44■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Ccdc173A0JLY1 547 aa21.44■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Ankrd63A2ARS0 390 aa21.44■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 PrkcshO08795 521 aa21.44■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Usp25P57080 1055 aa21.44■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Myl10Q62082 202 aa21.44■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Msl1Q6PDM1 616 aa21.44■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Cfap58B2RW38 873 aa21.43■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Rbm15bQ6PHZ5 887 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Slc44a1Q6X893 653 aa21.43■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Rbm33Q9CXK9 1231 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Naa16Q9DBB4 864 aa21.43■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Rgs12Q8CGE9 1381 aa21.43■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Mctp1E9PV86 951 aa21.43■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Celf1P28659 486 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Rps8P62242 208 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Bola3Q8CEI1 110 aa21.43■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Ccdc47Q9D024 483 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Tyro3P55144 880 aa21.42■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Cnnm2Q3TWN3 875 aa21.42■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Krt40Q6IFX3 439 aa21.42■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 CpdO89001 1377 aa21.42■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Cd3dP04235 173 aa21.41■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Tmem109Q3UBX0 243 aa21.41■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Stag1Q9D3E6 1258 aa21.41■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Sh3bgrQ9WUZ7 214 aa21.41■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Naaladl2A0A0N4SUJ3 795 aa21.41■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Gm7347D3YYI9 267 aa21.41■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Speer4aF8VPX6 267 aa21.41■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Tuft1O08970 390 aa21.41■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Ccdc162pQ0VG85 912 aa21.41■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Col4a3bpQ9EQG9 624 aa21.41■■□□□ 1.02
Trim58-201ENSMUST00000075084 Dennd3A2RT67 1274 aa21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.8 ms