RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018755.9

Pdlim4-201, Transcript of PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdlim4, Length 1,182 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ube3cQ80U95 1083 aa27.38■■□□□ 1.97
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Pdlim4-201ENSMUST00000018755 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Fam84aQ9D650 292 aa27.38■■□□□ 1.97
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Tfcp2l1Q3UNW5 479 aa27.37■■□□□ 1.97
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 SfswapQ3USH5 945 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Tigd5Q499M4 642 aa27.37■■□□□ 1.97
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ankrd13aQ80UP5 588 aa27.37■■□□□ 1.97
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Snap47Q8R570 413 aa27.37■■□□□ 1.97
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Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Lgr6Q3UVD5 967 aa27.36■■□□□ 1.97
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Mapk4Q6P5G0 583 aa27.36■■□□□ 1.97
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Nme8Q715T0 586 aa27.36■■□□□ 1.97
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Tmem39bQ810L4 492 aa27.36■■□□□ 1.97
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Hps4Q99KG7 671 aa27.36■■□□□ 1.97
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rnf181Q9CY62 165 aa27.36■■□□□ 1.97
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Lbhd1A0A087WPA0 259 aa27.35■■□□□ 1.97
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Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Sh2d1b2Q45HK4 132 aa27.35■■□□□ 1.97
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Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Slc26a8Q8R0C3 999 aa27.35■■□□□ 1.97
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Txnrd3Q99MD6 652 aa27.35■■□□□ 1.97
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Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cfap69Q8BH53 942 aa27.34■■□□□ 1.97
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Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Tspyl2Q7TQI8 677 aa27.33■■□□□ 1.97
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ube3bQ9ES34 1070 aa27.33■■□□□ 1.97
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Tbc1d2bQ3U0J8 965 aa27.32■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gm11437Q5QR91 290 aa27.32■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Adam39Q7M762 756 aa27.32■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Spata21Q8BHW6 681 aa27.32■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Krt25Q8VCW2 446 aa27.32■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Usp17ldG5E8G2 545 aa27.31■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Usp17lcG5E8I7 545 aa27.31■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Itgb7P26011 806 aa27.31■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Krt40Q6IFX3 439 aa27.31■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 TnksQ6PFX9 1320 aa27.31■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Traf5P70191 558 aa27.3■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cdcp1Q5U462 833 aa27.3■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Gimap3Q99MI6 301 aa27.3■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Myh3P13541 1940 aa27.29■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Clrn2B2RVW2 232 aa27.29■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Hspa8P63017 646 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Spryd7Q3TFQ1 196 aa27.29■■□□□ 1.96
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Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ddx49Q4FZF3 480 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Trnp1Q80ZI1 223 aa27.29■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Znf521Q6KAS7 1311 aa27.29■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Col11a1Q61245 1804 aa27.28■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Pitpnm2Q6ZPQ6 1335 aa27.28■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Grem2O88273 168 aa27.28■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Il31raQ8K5B1 716 aa27.28■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Taf5lQ91WQ5 589 aa27.28■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 MsraQ9D6Y7 233 aa27.28■■□□□ 1.96
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Il21rQ9JHX3 529 aa27.28■■□□□ 1.96
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Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa27.26■■□□□ 1.95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
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Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Krt74Q6IFZ9 495 aa27.26■■□□□ 1.95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 C8aQ8K182 587 aa27.26■■□□□ 1.95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ppil4Q9CXG3 492 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 FliiQ9JJ28 1271 aa27.26■■□□□ 1.95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Epb41l3Q9WV92 929 aa27.26■■□□□ 1.95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Tanc1Q0VGY8 1856 aa27.25■■□□□ 1.95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Flvcr1B2RXV4 560 aa27.25■■□□□ 1.95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Slc27a3O88561 667 aa27.25■■□□□ 1.95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Trmt1Q3TX08 663 aa27.25■■□□□ 1.95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ddx55Q6ZPL9 600 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Tbc1d4Q8BYJ6 1307 aa27.24■■□□□ 1.95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Zbtb7aO88939 569 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 MthfsQ9D110 203 aa27.24■■□□□ 1.95
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Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Rtp1Q8C8C1 263 aa27.23■■□□□ 1.95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Xrcc4Q924T3 326 aa27.23■■□□□ 1.95
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Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Atoh1P48985 351 aa27.22■■□□□ 1.95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Irx3P81067 507 aa27.22■■□□□ 1.95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Ppp4cP97470 307 aa27.22■■□□□ 1.95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Pla2g4fQ50L41 855 aa27.22■■□□□ 1.95
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Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Txnrd2Q9JLT4 524 aa27.22■■□□□ 1.95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Prr14lE9Q7C4 1971 aa27.22■■□□□ 1.95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Mmp20P57748 482 aa27.21■■□□□ 1.95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Siah1aP61092 282 aa27.21■■□□□ 1.95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Znf710Q3U288 666 aa27.21■■□□□ 1.95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Cyp4f37Q3V1F1 546 aa27.21■■□□□ 1.95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Sept14Q9DA97 430 aa27.21■■□□□ 1.95
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Nol8Q3UHX0 1147 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 PaoxQ8C0L6 504 aa27.2■■□□□ 1.94
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Zbed3Q9D0L1 228 aa27.2■■□□□ 1.94
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Zbtb12Q9Z150 459 aa27.2■■□□□ 1.94
Pdlim4-201ENSMUST00000018755 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa27.19■■□□□ 1.94
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