RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001711.5

Hoxc6-201, Transcript of Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxc6, Length 1,581 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Adgra3Q7TT36 1310 aa22.42■■□□□ 1.18
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ppfia1B2RXQ2 1266 aa22.42■■□□□ 1.18
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa22.42■■□□□ 1.18
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cnot7Q60809 285 aa22.42■■□□□ 1.18
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tm4sf1Q64302 202 aa22.42■■□□□ 1.18
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ankrd13aQ80UP5 588 aa22.42■■□□□ 1.18
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ppil2Q9D787 521 aa22.42■■□□□ 1.18
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 NrapQ80XB4 1728 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pet2A2AHY8 747 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ddx11Q6AXC6 880 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 LdhdQ7TNG8 484 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kbtbd13Q8C828 458 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ndfip2Q91ZP6 311 aa22.41■■□□□ 1.18
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Aox4Q3TYQ9 1336 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mb21d2Q8C525 428 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ascc2Q91WR3 749 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1700018B08RikQ9DA83 213 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pappa2E9PZ87 1789 aa22.4■■□□□ 1.18
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fdx1P46656 188 aa22.39■■□□□ 1.18
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dynll1P63168 89 aa22.39■■□□□ 1.18
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ppp4cP97470 307 aa22.39■■□□□ 1.18
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Frmd7A2AD83 703 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pcdhb9E9Q5G2 828 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cyp2d9P11714 504 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lmbrd2Q8C561 694 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ubxn2aQ99KJ0 258 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 CrcpO35427 148 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Grem2O88273 168 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 MecomP14404 1042 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Wnt10bP48614 389 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Trappc12Q8K2L8 797 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ppp6r3Q922D4 844 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tgm5Q9D7I9 724 aa22.38■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Myh6Q02566 1938 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pnpla6Q3TRM4 1355 aa22.37■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 UncxO08934 530 aa22.37■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Hap1O35668 628 aa22.37■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nucb1Q02819 459 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tmed8Q3UHI4 326 aa22.37■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lamc2Q61092 1191 aa22.37■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Scaf8Q6DID3 1268 aa22.37■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Trim56Q80VI1 734 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nek11Q8C0Q4 628 aa22.37■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Adam1bQ8R534 806 aa22.37■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Txnrd3Q99MD6 652 aa22.37■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Trim30dE9PWL0 497 aa22.36■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Myo1bP46735 1107 aa22.36■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Add2Q9QYB8 725 aa22.36■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 LeprP48356 1162 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tbc1d2bQ3U0J8 965 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Adck5Q80V03 582 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tbc1d23Q8K0F1 684 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Stn1Q8K2X3 378 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Aox3G3X982 1335 aa22.35■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gas1Q01721 343 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Oog3Q3UWY1 500 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lman1lQ8VCD3 505 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pold4Q9CWP8 107 aa22.34■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 NesQ6P5H2 1864 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slc4a4O88343 1079 aa22.33■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 AidaQ8C4Q6 305 aa22.33■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Shtn1Q8K2Q9 631 aa22.33■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Top1mtQ8R4U6 593 aa22.33■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tbc1d7Q9D0K0 293 aa22.33■■□□□ 1.17
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gnat2P50149 354 aa22.33■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gxylt1Q3UHH8 404 aa22.33■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tmem79Q9D709 391 aa22.33■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lins1Q3U1D0 764 aa22.32■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Xrcc4Q924T3 326 aa22.32■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Trpm7Q923J1 1863 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tigd5Q499M4 642 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tex2Q6ZPJ0 1128 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Myl6bQ8CI43 207 aa22.31■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 StrbpQ91WM1 672 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slc4a9E9PUP3 929 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 CnpP16330 420 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cacnb3P54285 484 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Stac3Q8BZ71 360 aa22.3■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lbhd1A0A087WPA0 259 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ccdc183A2AJB1 534 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Hspd1P63038 573 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Irf6P97431 467 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rpusd2Q149F1 553 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tsc2Q61037 1814 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rbm43Q99J64 343 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 AfdnQ9QZQ1 1820 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Prss51A0A286YDY8 319 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ces1aE9PYP1 563 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sez6lQ6P1D5 963 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zbed3Q9D0L1 228 aa22.29■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sik3Q6P4S6 1311 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mum1l1Q4VA55 681 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Alx1Q8C8B0 326 aa22.28■■□□□ 1.16
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ces1dQ8VCT4 565 aa22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.8 ms