RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635861.1

CLN3-241, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,404 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-241ENST00000635861 A0A087WW49 117 aa14.21□□□□□ -0.13
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CLN3-241ENST00000635861 FCN1O00602 326 aa14.21□□□□□ -0.13
CLN3-241ENST00000635861 APOA2P02652 100 aa14.21□□□□□ -0.13
CLN3-241ENST00000635861 GP9P14770 177 aa14.21□□□□□ -0.13
CLN3-241ENST00000635861 OR56B1Q8NGI3 324 aa14.21□□□□□ -0.13
CLN3-241ENST00000635861 RHOVQ96L33 236 aa14.21□□□□□ -0.13
CLN3-241ENST00000635861 OR1A1Q9P1Q5 309 aa14.21□□□□□ -0.13
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CLN3-241ENST00000635861 MUC7Q8TAX7 377 aa14.17□□□□□ -0.14
CLN3-241ENST00000635861 CASTOR1Q8WTX7 329 aa14.17□□□□□ -0.14
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CLN3-241ENST00000635861 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.16□□□□□ -0.14
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CLN3-241ENST00000635861 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa14.16□□□□□ -0.14
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CLN3-241ENST00000635861 SLC35D1Q9NTN3 355 aa14.16□□□□□ -0.14
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CLN3-241ENST00000635861 CABLES2Q9BTV7 478 aa14.15□□□□□ -0.14
CLN3-241ENST00000635861 RNF167Q9H6Y7 350 aa14.15□□□□□ -0.14
CLN3-241ENST00000635861 RAB22AQ9UL26 194 aa14.15□□□□□ -0.14
CLN3-241ENST00000635861 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa14.15□□□□□ -0.14
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CLN3-241ENST00000635861 CD3GP09693 182 aa14.15□□□□□ -0.14
CLN3-241ENST00000635861 RRASP10301 218 aa14.15□□□□□ -0.14
CLN3-241ENST00000635861 AADACP22760 399 aa14.15□□□□□ -0.14
CLN3-241ENST00000635861 PLAC9Q5JTB6 97 aa14.15□□□□□ -0.14
CLN3-241ENST00000635861 OR10J5Q8NHC4 309 aa14.15□□□□□ -0.14
CLN3-241ENST00000635861 GRPEL2Q8TAA5 225 aa14.15□□□□□ -0.14
CLN3-241ENST00000635861 CNIH1O95406 144 aa14.14□□□□□ -0.15
CLN3-241ENST00000635861 TMEM177Q53S58 311 aa14.14□□□□□ -0.15
CLN3-241ENST00000635861 CASC10Q5T4H9 136 aa14.14□□□□□ -0.15
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