RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	MPPED1	O15442	326 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	FABP7	O15540	132 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	IFNA6	P05013	189 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	GNB3	P16520	340 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	DEFB125	Q8N687	156 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	C8orf4	Q9NR00	106 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	CRYZL1	O95825	349 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	CD7	P09564	240 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	AADAC	P22760	399 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	CD81	P60033	236 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	RHOG	P84095	191 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	FABP5	Q01469	135 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	LCN12	Q6JVE5	192 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	SNAPC3	Q92966	411 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	SCN3B	Q9NY72	215 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078		S4R3C0	116 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078		A0A0B4J203	849 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	LINC00473	A8K010	186 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	PPP5D1	E7EU14	171 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	BMPR1B	O00238	502 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	IGHV3-23	P01764	117 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	FCGR3A	P08637	254 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	OR9G9	P0C7N8	305 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	MAP2K4	P45985	399 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	OR10A3	P58181	314 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF45	Q02386	682 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	ATP5G2	Q06055	141 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	CBX3	Q13185	183 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	IRF3	Q14653	427 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	RTL8B	Q17RB0	113 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM177	Q53S58	311 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	RNLS	Q5VYX0	342 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078		Q8N402	240 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	RAB3C	Q96E17	227 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	USMG5	Q96IX5	58 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	NEURL2	Q9BR09	285 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	GINS4	Q9BRT9	223 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078		V9GY05	133 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	HMX3	A6NHT5	357 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF785	A8K8V0	405 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	OR2J3	O76001	311 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	BRI3	O95415	125 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	SERPINB10	P48595	397 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	TPBG	Q13641	420 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	PRSS8	Q16651	343 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	GUCA2B	Q16661	112 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM68	Q96MH6	324 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	RAB22A	Q9UL26	194 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TCF4-262	ENST00000628078	SHISA3	A0PJX4	238 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TCF4-262	ENST00000628078	SMIM30	A4D0T7	59 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TCF4-262	ENST00000628078	ARL6IP5	O75915	188 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TCF4-262	ENST00000628078	TPPP	O94811	219 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TCF4-262	ENST00000628078	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TCF4-262	ENST00000628078	ARFRP1	Q13795	201 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TCF4-262	ENST00000628078	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TCF4-262	ENST00000628078	TEX45	Q8NA69	505 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TCF4-262	ENST00000628078	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TCF4-262	ENST00000628078	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TCF4-262	ENST00000628078	DDB2	Q92466	427 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TCF4-262	ENST00000628078	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TCF4-262	ENST00000628078	PEMT	Q9UBM1	199 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TCF4-262	ENST00000628078	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TCF4-262	ENST00000628078	OR11H12	B2RN74	326 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-262	ENST00000628078	RAB27B	O00194	218 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-262	ENST00000628078	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-262	ENST00000628078	FCGR3B	O75015	233 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TCF4-262	ENST00000628078	TUSC2	O75896	110 aa		10.19	□□□□□ -0.78

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