RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 OR10D4PQ8NGN7 298 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 RAB24Q969Q5 203 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 TNFSF13O75888 250 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 IFNA1P01562 189 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 COL8A2P25067 703 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 ATP6V1FQ16864 119 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 OR10P1Q8NGE3 313 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 NINJ1Q92982 152 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 PYGO2Q9BRQ0 406 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 DKK4Q9UBT3 224 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 IFNL4K9M1U5 179 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 OPN1MWP04001 364 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 OPN1MW2P0DN77 364 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 OPN1MW3P0DN78 364 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 DUTP33316 252 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 PAX5Q02548 391 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 EDDM3AQ14507 147 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF66Q6ZN08 573 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 LRP11Q86VZ4 500 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 NECAP1Q8NC96 275 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 LRRC29Q8WV35 223 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 TAAR6Q96RI8 345 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 PRDM13Q9H4Q3 707 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF134P52741 427 aa11.08□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 AARDQ4LEZ3 155 aa11.08□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 OR4X1Q8NH49 305 aa11.08□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM170AQ8WVE7 144 aa11.08□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 SNX22Q96L94 193 aa11.08□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 OR6C3Q9NZP0 311 aa11.08□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 AQP7O14520 342 aa11.08□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 GNB2P62879 340 aa11.08□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 SMIM21Q3B7S5 101 aa11.08□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 IGFL2Q6UWQ7 119 aa11.08□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 SEM1Q6ZVN7 128 aa11.08□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF383Q8NA42 475 aa11.08□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 CTDSP1Q9GZU7 261 aa11.08□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 DMRT1Q9Y5R6 373 aa11.08□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM250H0YL14 139 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 CGAP01215 116 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV3-13P01766 116 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV3-7P01780 117 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM241Q24JQ0 296 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 OR4F5Q8NH21 305 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 R3HDM4Q96D70 268 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 OR4F4Q96R69 305 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 DSCAML1Q8TD84 2053 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 TRAV3A0A0B4J244 114 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 PRSS46E5RG02 174 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 PAGE4O60829 102 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 BMP5P22003 454 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 HTD2P86397 168 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 BSXQ3C1V8 233 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 RPL39P5Q59GN2 51 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 OR51G1Q8NGK1 321 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 DIRC2Q96SL1 478 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 PPP1R2P9O14990 202 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 PRDX2P32119 198 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 PSMB3P49720 205 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 LOXL3P58215 753 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 C1orf159Q96HA4 380 aa11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 MORN2Q502X0 79 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 C9orf152Q5JTZ5 239 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 STARD4Q96DR4 205 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 DSCAMO60469 2012 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 PRR33A8MZF0 331 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 SLC31A2O15432 143 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 FABP4P15090 132 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 S100A2P29034 98 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 HOXC12P31275 282 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 SSX9Q7RTT3 188 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 OR2Z1Q8NG97 314 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 HIST1H2BLQ99880 126 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 IFI27L2Q9H2X8 130 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 ASCL3Q9NQ33 180 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 MANBALQ9NQG1 85 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 WDR83OSQ9Y284 106 aa11.06□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 SRRM5B3KS81 715 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 FCGR3BO75015 233 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 PRSS8Q16651 343 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 GCSAMQ8N6F7 178 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 OR10A7Q8NGE5 316 aa11.05□□□□□ -0.64
C9orf170-201ENST00000623052 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms