RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 SPANXA1Q9NS26 97 aa6.46□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 GAGE10A6NGK3 116 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 GABARAPH6UMI1 98 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 ZNF728P0DKX0 622 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 C8orf88P0DMB2 117 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 LYL1P12980 280 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 CTLA4P16410 223 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 PTH2RP49190 550 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 CLRN1P58418 232 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 WDR38Q5JTN6 314 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 SLC18B1Q6NT16 456 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 DNM1P46Q6ZS02 220 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 OR10AC1Q8NH08 325 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 TNFSF11O14788 317 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 TAAR5O14804 337 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 RAMP1O60894 148 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 HLA-DOBP13765 273 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 PTGDSP41222 190 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 TCTAP57738 103 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 PLXDC2Q6UX71 529 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 OR51A4Q8NGJ6 313 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 DUX3Q96PT4 197 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 MUC3AQ02505 3323 aa6.45□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 CUL9Q8IWT3 2517 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 E9PLN8 166 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 HIST3H3Q16695 136 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 LCN10Q6JVE6 187 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 ZNF709Q8N972 641 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 IMMP2LQ96T52 175 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 ALPK2Q86TB3 2170 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 EFNA2O43921 213 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 HLA-DQA2P01906 255 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 GLIPR1P48060 266 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 TLE1Q04724 770 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 KIR2DS1Q14954 304 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 OR5B3Q8NH48 314 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 TMED6Q8WW62 240 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 RPEQ96AT9 228 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 MBD6Q96DN6 1003 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 ABHD6Q9BV23 337 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 TMEM126AQ9H061 195 aa6.44□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 A0A1B0GW64 132 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 A0A1W2PPI3 338 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 ZFAND5O76080 213 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 CGAP01215 116 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 CD8AP01732 235 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 CSN2P05814 226 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 LPAR6P43657 344 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 DCAF12Q5T6F0 453 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 FAM166AQ6J272 317 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 OR52N5Q8NH56 324 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 DDIT4LQ96D03 193 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 OR4F4Q96R69 305 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 ULBP3Q9BZM4 244 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 FSCN3Q9NQT6 498 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 KLHL13Q9P2N7 655 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 SDK1Q7Z5N4 2213 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 FREM3P0C091 2139 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 CCDC179H3BU77 68 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 MT-CO3P00414 261 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 CDK2P24941 298 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 FOXF1Q12946 379 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 OR7A5Q15622 319 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 OTPQ5XKR4 325 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 ZNF488Q96MN9 340 aa6.43□□□□□ -1.38
HCG18-244ENST00000602516 OCIAD1Q9NX40 245 aa6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms