RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593072.5

EFTUD2-225, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 5

Gene EFTUD2, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-225	ENST00000593072	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	RAB12	Q6IQ22	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	LINC00596	Q86U02	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	RAB3C	Q96E17	227 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	PECR	Q9BY49	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072		A8MZ25	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072		J3QRK9	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	CTDSPL	O15194	276 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	SSX5	O60225	188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	SOX15	O60248	233 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	FUT3	P21217	361 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	ZNF134	P52741	427 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	ARPC4	P59998	168 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	ACTB	P60709	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	OXA1L	Q15070	435 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	TRIM16L	Q309B1	348 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	PYDC2	Q56P42	97 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	NEK7	Q8TDX7	302 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	CLCC1	Q96S66	551 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	SRR	Q9GZT4	340 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	AK3	Q9UIJ7	227 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	CXorf65	A6NEN9	183 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	GABARAP	H6UMI1	98 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	FCN1	O00602	326 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	RGS13	O14921	159 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	LANCL1	O43813	399 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	CA11	O75493	328 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	TPPP	O94811	219 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	GLA	P06280	429 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	FCER2	P06734	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	CD3G	P09693	182 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	GSTT2	P0CG29	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	GSTT2B	P0CG30	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	CD40LG	P29965	261 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	PRSS3	P35030	304 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	PPP5C	P53041	499 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	TPPP2	P59282	170 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	GNG2	P59768	71 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	ARFRP1	Q13795	201 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	ARL6IP1	Q15041	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	PLGLA	Q15195	96 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	BAK1	Q16611	211 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	HACD4	Q5VWC8	232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072		Q8N402	240 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR52I2	Q8NH67	350 aa		4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms