RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 RAB18Q9NP72 206 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 ISYNA1Q9NPH2 558 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 RHBDL2Q9NX52 303 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 PITPNC1Q9UKF7 332 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 NOTCH3Q9UM47 2321 aa3.38□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TRAV18A0A075B6X5 111 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 PSMB11A5LHX3 300 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 DPPA5A6NC42 116 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 VGLL3A8MV65 326 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 G3V4G9 280 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 LY6LH3BQJ8 138 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 M0QZ24 198 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 MFNGO00587 321 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 ATP6V0E1O15342 81 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 FABP7O15540 132 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TNFSF12O43508 249 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 ORC5O43913 435 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 OR2F2O95006 317 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 NAPSAO96009 420 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 GLAP06280 429 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 GSTT2P0CG29 244 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 GSTT2BP0CG30 244 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 RPA2P15927 270 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TALDO1P37837 337 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 CEACAM6P40199 344 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 GPR12P47775 334 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 RAB7AP51149 207 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 F2RL1P55085 397 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM50BP56557 158 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 FXYD4P59646 89 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 DEFA6Q01524 100 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 C2orf68Q2NKX9 166 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 MORN2Q502X0 79 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 GPR107Q5VW38 600 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TRAT1Q6PIZ9 186 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 IDO2Q6ZQW0 420 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 MOB1BQ7L9L4 216 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 SLC35E3Q7Z769 313 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM17Q86X19 198 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 SNX29P2Q8IUI4 249 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 ODF3L1Q8IXM7 274 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 GVQW1Q8N7I0 195 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 SAMD12Q8N8I0 201 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 Q8NFD4 153 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 OR5AU1Q8NGC0 362 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 GRPEL2Q8TAA5 225 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 C2CD4CQ8TF44 421 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM170AQ8WVE7 144 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 GALMQ96C23 342 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 C5orf30Q96GV9 206 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 AKR1E2Q96JD6 320 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 KCTD7Q96MP8 289 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 GINS4Q9BRT9 223 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 FUNDC2Q9BWH2 189 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 FBXL15Q9H469 300 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 RDH8Q9NYR8 311 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 JPT1Q9UK76 154 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 GAB2Q9UQC2 676 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 KCNK7Q9Y2U2 307 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 LRRC42Q9Y546 428 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 WSB1Q9Y6I7 421 aa3.37□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TNCP24821 2201 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TGP01266 2768 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 A0A087WXM4 84 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 FAM90A10PA6NDY2 464 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 FAM25AB3EWG3 89 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 FAM25CB3EWG5 89 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 FAM25GB3EWG6 89 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 G3V318 75 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 LDLRAD4O15165 306 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 SLC25A17O43808 307 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 SSX5O60225 188 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 HPGDSO60760 199 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 TSPAN9O75954 239 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 MOSP00540 346 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 OR8U9P0C7N5 309 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 FAM90A13PP0C7W8 464 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 FAM90A24PP0C7X0 464 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 FAM106CPP0CH98 169 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 GZMHP20718 246 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 ARPC4P59998 168 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 ACTBP60709 375 aa3.36□□□□□ -1.87
TMOD3-204ENST00000558666 NDPQ00604 133 aa3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms