RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558285.5

USP3-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3, Length 1,742 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-208ENST00000558285 TUBA4BQ9H853 241 aa7.01□□□□□ -1.29
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USP3-208ENST00000558285 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 METTL21EPA6NDL7 271 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 SCGNO76038 276 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 OR2F2O95006 317 aa7.01□□□□□ -1.29
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USP3-208ENST00000558285 C2orf68Q2NKX9 166 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 C1orf100Q5SVJ3 147 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 IL34Q6ZMJ4 242 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 ZNF497Q6ZNH5 498 aa7.01□□□□□ -1.29
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USP3-208ENST00000558285 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.01□□□□□ -1.29
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USP3-208ENST00000558285 V9GY05 133 aa7.01□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa7□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 J3QR06 171 aa7□□□□□ -1.29
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USP3-208ENST00000558285 ARPC5O15511 151 aa7□□□□□ -1.29
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USP3-208ENST00000558285 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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USP3-208ENST00000558285 HNF4GQ14541 408 aa7□□□□□ -1.29
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USP3-208ENST00000558285 PRR31Q5SQ13 230 aa7□□□□□ -1.29
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USP3-208ENST00000558285 Q6ZSV7 163 aa7□□□□□ -1.29
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USP3-208ENST00000558285 OR4P4Q8NGL7 312 aa7□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 OR13A1Q8NGR1 328 aa7□□□□□ -1.29
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USP3-208ENST00000558285 Q96M66 194 aa7□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 ABHD1Q96SE0 405 aa7□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 NEU1Q99519 415 aa7□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 GFOD1Q9NXC2 390 aa7□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.99□□□□□ -1.29
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USP3-208ENST00000558285 SIX6O95475 246 aa6.99□□□□□ -1.29
USP3-208ENST00000558285 IGLV1-47P01700 117 aa6.99□□□□□ -1.29
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USP3-208ENST00000558285 BLOC1S1P78537 153 aa6.98□□□□□ -1.29
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USP3-208ENST00000558285 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.98□□□□□ -1.29
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USP3-208ENST00000558285 NDUFB6O95139 128 aa6.98□□□□□ -1.29
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