RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556648.1

TMEM260-211, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 2

Gene TMEM260, Length 2,013 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-211ENST00000556648 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa8.34□□□□□ -1.07
TMEM260-211ENST00000556648 LFNGQ8NES3 379 aa8.34□□□□□ -1.07
TMEM260-211ENST00000556648 DDB2Q92466 427 aa8.34□□□□□ -1.07
TMEM260-211ENST00000556648 RPRMQ9NS64 109 aa8.34□□□□□ -1.07
TMEM260-211ENST00000556648 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TMEM260-211ENST00000556648 HCFC1P51610 2035 aa8.34□□□□□ -1.07
TMEM260-211ENST00000556648 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa8.34□□□□□ -1.07
TMEM260-211ENST00000556648 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa8.34□□□□□ -1.07
TMEM260-211ENST00000556648 A0A1B0GW64 132 aa8.34□□□□□ -1.07
TMEM260-211ENST00000556648 IGKV1D-33P01593 117 aa8.34□□□□□ -1.07
TMEM260-211ENST00000556648 IGKV1-33P01594 117 aa8.34□□□□□ -1.07
TMEM260-211ENST00000556648 IRF2P14316 349 aa8.34□□□□□ -1.07
TMEM260-211ENST00000556648 DAOP14920 347 aa8.34□□□□□ -1.07
TMEM260-211ENST00000556648 NDUFB7P17568 137 aa8.34□□□□□ -1.07
TMEM260-211ENST00000556648 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TMEM260-211ENST00000556648 TMPRSS3P57727 454 aa8.34□□□□□ -1.07
TMEM260-211ENST00000556648 ZNF439Q8NDP4 499 aa8.34□□□□□ -1.07
TMEM260-211ENST00000556648 RXFP4Q8TDU9 374 aa8.34□□□□□ -1.07
TMEM260-211ENST00000556648 RND1Q92730 232 aa8.34□□□□□ -1.07
TMEM260-211ENST00000556648 PBDC1Q9BVG4 233 aa8.34□□□□□ -1.07
TMEM260-211ENST00000556648 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.34□□□□□ -1.07
TMEM260-211ENST00000556648 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa8.34□□□□□ -1.07
TMEM260-211ENST00000556648 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 C15orf62A8K5M9 175 aa8.33□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 E7EQL1 145 aa8.33□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 TMPRSS2O15393 492 aa8.33□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 HPRT1P00492 218 aa8.33□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 PLAUP00749 431 aa8.33□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 RAB2AP61019 212 aa8.33□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 ACSM6Q6P461 480 aa8.33□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 LCN15Q6UWW0 184 aa8.33□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 LYPD2Q6UXB3 125 aa8.33□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 LYG1Q8N1E2 194 aa8.33□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 ZNF383Q8NA42 475 aa8.33□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 CLDND2Q8NHS1 167 aa8.33□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 CD300LFQ8TDQ1 290 aa8.33□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 ZNF251Q9BRH9 671 aa8.33□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa8.33□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 KIAA1456Q9P272 454 aa8.33□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 DOCK11Q5JSL3 2073 aa8.33□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 FAM90A27PA6NNH2 459 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 SRP19P09132 144 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 MYOD1P15172 320 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 CCL3L1P16619 93 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 CEBPGP53567 150 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 RBPJQ06330 500 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 CLCC1Q96S66 551 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 S1PR3Q99500 378 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 SAP30LQ9HAJ7 183 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 TMEM140Q9NV12 185 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 LAMP3Q9UQV4 416 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 PCNX1Q96RV3 2341 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 NKX6-3A6NJ46 265 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 M0R036 132 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 OR8U8P0C7N1 319 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 TNFRSF1AP19438 455 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 FGF7P21781 194 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 RELBQ01201 579 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 TLE4Q04727 773 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 NCMAPQ5T1S8 102 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 LINC01560Q8TB33 94 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 VKORC1Q9BQB6 163 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 TMEM147Q9BVK8 224 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 GNG13Q9P2W3 67 aa8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.31□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 C7orf77A4D0Y5 90 aa8.31□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 TMEM178BH3BS89 294 aa8.31□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 ITGB1BP1O14713 200 aa8.31□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 IFNA17P01571 189 aa8.31□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 RAB7AP51149 207 aa8.31□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 CDSNQ15517 529 aa8.31□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.31□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 ZNF787Q6DD87 383 aa8.31□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.31□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 CCL17Q92583 94 aa8.31□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 CORO2AQ92828 525 aa8.31□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 CTSZQ9UBR2 303 aa8.31□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa8.31□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 BTBD17A6NE02 478 aa8.3□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 COLCA2A8K830 154 aa8.3□□□□□ -1.08
TMEM260-211ENST00000556648 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
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