RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555658.5

FOXN3-210, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 3

Gene FOXN3, Length 648 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-210ENST00000555658 OR2H2O95918 312 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 CD8AP01732 235 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 SOD3P08294 240 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 DANCRP0C864 163 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 PPIAL4FP0DN26 164 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 PTHLHP12272 177 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 SSTR2P30874 369 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 MDH2P40926 338 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 GABRA2P47869 451 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 TAS2R46P59540 309 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 TAS2R19P59542 299 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 MEF2DQ14814 521 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 AKIRIN2Q53H80 203 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 FREM1Q5H8C1 2179 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 GPR157Q5UAW9 335 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 STEAP1BQ6NZ63 245 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 Q6P435 159 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 LYG2Q86SG7 212 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 COMMD7Q86VX2 200 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 GCSAMQ8N6F7 178 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 ZNF383Q8NA42 475 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 TMEM229BQ8NBD8 167 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 SUMF2Q8NBJ7 301 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 DEFB108BQ8NET1 73 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 OR5D13Q8NGL4 314 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 RNF125Q96EQ8 232 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 SMIM12Q96EX1 92 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 TIMD4Q96H15 378 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 SULT4A1Q9BR01 284 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 REG4Q9BYZ8 158 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 WDR13Q9H1Z4 485 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 TMEM106BQ9NUM4 274 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 IL36RNQ9UBH0 155 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 AK3Q9UIJ7 227 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 KIF25Q9UIL4 384 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 PPIAL4AQ9Y536 164 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 MMP24Q9Y5R2 645 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 ESPL1Q14674 2120 aa3.4□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 SHANK1Q9Y566 2161 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 MEIKINA0A087WXM9 373 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 TRAV24A0A0B4J272 114 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 A0A1B0GV72 72 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 MEIS3P1A6NDR6 274 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 NKX6-3A6NJ46 265 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 DISC1C4P0D8 188 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 K7EQM0 130 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 HSPB6O14558 160 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 PLA2G10O15496 165 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 NDUFB3O43676 98 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 LANCL1O43813 399 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 RAMP3O60896 148 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 GGCTO75223 188 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 SCGB2A1O75556 95 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 FSTL3O95633 263 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 CLDN1O95832 211 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 C1QBP02746 253 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 MT-ND4P03905 459 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 CD3DP04234 171 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 AKAIN1P0CW23 69 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 PSG2P11465 335 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 GZMHP20718 246 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 HLA-DMAP28067 261 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 KIR2DS4P43632 304 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 EFNA4P52798 201 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 RPS20P60866 119 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 RAB11AP62491 216 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 KIR2DS1Q14954 304 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 TMEM249Q2WGJ8 235 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 SPRNQ5BIV9 151 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 TEX36Q5VZQ5 186 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 OLFML2AQ68BL7 652 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 LEMD1Q68G75 181 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 SLC35E4Q6ICL7 350 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 C11orf71Q6IPW1 123 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 MYO7BQ6PIF6 2116 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 PLET1Q6UQ28 207 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 TEX261Q6UWH6 196 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 KCTD9Q7L273 389 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 MOB1BQ7L9L4 216 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 TCF24Q7RTU0 167 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 HOGA1Q86XE5 327 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 ZGRF1Q86YA3 2104 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 BPIFB2Q8N4F0 458 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 GVQW1Q8N7I0 195 aa3.39□□□□□ -1.87
FOXN3-210ENST00000555658 BEST4Q8NFU0 473 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms