RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 POC1AQ8NBT0 407 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 SOCS1O15524 211 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 ZNF737O75373 536 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 OR8U8P0C7N1 319 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 KIRREL1Q96J84 757 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 AP4M1O00189 453 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 TNFSF12O43508 249 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 ARL6IP5O75915 188 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 PRH1P02810 166 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 MT-ND4LP03901 98 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 RAB5CP51148 216 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 F2RL1P55085 397 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 MMDQ15546 238 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 Q8TCH9 128 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 RPS4Y2Q8TD47 263 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 C14orf144Q96I85 54 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 TAF9BQ9HBM6 251 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 A0A1W2PPH5 198 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 RNF222A6NCQ9 220 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 PIN1P1O15428 100 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 IGHV3-23P01764 117 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 UBE2E1P51965 193 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 OSR2Q8N2R0 312 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 OR5T1Q8NG75 326 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 ERGIC1Q969X5 290 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 MALSU1Q96EH3 234 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 GGACTQ9BVM4 153 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 TREM1Q9NP99 234 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 PARP11Q9NR21 331 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 CALYQ9NYX4 217 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 OR8U9P0C7N5 309 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 TMEM11P17152 192 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 PPT1P50897 306 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 ZNF134P52741 427 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 ARFRP1Q13795 201 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 ARRDC1Q8N5I2 433 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 OR8U1Q8NH10 309 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 STOML3Q8TAV4 291 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 HINT2Q9BX68 163 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 METTL9Q9H1A3 318 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 TUBA4BQ9H853 241 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 KPTNQ9Y664 436 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 TMEM210A6NLX4 147 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 GTF2F2P13984 249 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 CD33P20138 364 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 CD81P60033 236 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 C11orf88Q6PI97 169 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 DEGS2Q6QHC5 323 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 PHYHIPQ92561 330 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 NEU1Q99519 415 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 DPM3Q9P2X0 92 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-212ENST00000548567 V9GYS6 101 aa6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms