RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540475.5

SEMA4D-223, Transcript of semaphorin 4D, human

TSL 3

Gene SEMA4D, Length 826 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA4D-223	ENST00000540475	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	ATP6V1G2	O95670	118 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	CTXN2	P0C2S0	81 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	TPPP2	P59282	170 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	CDNF	Q49AH0	187 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	HACD4	Q5VWC8	232 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	BVES	Q8NE79	360 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	STUB1	Q9UNE7	303 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475		U3KQK5	164 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475		A0A0G2JLM5	398 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	LINC00473	A8K010	186 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	SCGN	O76038	276 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	IGLV2-14	P01704	120 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	IGHV3-11	P01762	117 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	HLA-DQB1	P01920	261 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	TRGV3	P03979	118 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	TALDO1	P37837	337 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	SCAND1	P57086	179 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	UBE2K	P61086	200 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	PITPNA	Q00169	270 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	ARFRP1	Q13795	201 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	RTL8B	Q17RB0	113 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	HARBI1	Q96MB7	349 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	GINS4	Q9BRT9	223 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	LYST	Q99698	3801 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475		A0A075B6Q4	140 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	SHOX	O15266	292 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	SAP30	O75446	220 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	SLC22A5	O76082	557 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	CNIH1	O95406	144 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	IGLV1-51	P01701	117 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	GP9	P14770	177 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	SPN	P16150	400 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	AADAC	P22760	399 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	PRSS8	Q16651	343 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	CNIH2	Q6PI25	160 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	OR5T1	Q8NG75	326 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	ZP3	P21754	424 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	CBX3	Q13185	183 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	USMG5	Q96IX5	58 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	SSR3	Q9UNL2	185 aa		10.04	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	MSGN1	A6NI15	193 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475		A8MZ25	164 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	SSX5	O60225	188 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	TMEM127	O75204	238 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	TUSC2	O75896	110 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	CRYZL1	O95825	349 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	PSMB9	P28065	219 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	DYRK1A	Q13627	763 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	ZNF773	Q6PK81	442 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475		Q8N1Y9	231 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	OR4C12	Q96R67	309 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	OR51E2	Q9H255	320 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475		Q9H521	79 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		10.03	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
SEMA4D-223	ENST00000540475		A0A0A6YYH2	397 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SEMA4D-223	ENST00000540475	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SEMA4D-223	ENST00000540475	SMIM30	A4D0T7	59 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SEMA4D-223	ENST00000540475	TMEM235	A6NFC5	223 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SEMA4D-223	ENST00000540475		A6NJ64	397 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SEMA4D-223	ENST00000540475	LY86	O95711	162 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SEMA4D-223	ENST00000540475	OR9G9	P0C7N8	305 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SEMA4D-223	ENST00000540475	SDC2	P34741	201 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SEMA4D-223	ENST00000540475	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SEMA4D-223	ENST00000540475	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SEMA4D-223	ENST00000540475	CDK10	Q15131	360 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SEMA4D-223	ENST00000540475	MSMO1	Q15800	293 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SEMA4D-223	ENST00000540475	KLK9	Q2XQG4	91 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SEMA4D-223	ENST00000540475	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SEMA4D-223	ENST00000540475	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		10.02	□□□□□ -0.81
SEMA4D-223	ENST00000540475	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
SEMA4D-223	ENST00000540475	ASCL2	Q99929	193 aa		10.02	□□□□□ -0.81

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