RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IL17RELQ6ZVW7 336 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PDPNQ86YL7 162 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CADM3Q8N126 398 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 R3HDM4Q96D70 268 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AJUBAQ96IF1 538 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMR3AQ99954 134 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CENPEQ02224 2701 aa6.86□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARID1AO14497 2285 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCSO14618 274 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SIX6O95475 246 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MOSP00540 346 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HRASP01112 189 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGKV1D-33P01593 117 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGKV1-33P01594 117 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGKV1-39P01597 117 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGKV1-16P04430 117 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGKV1D-39P04432 117 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM106CPP0CH98 169 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NQO2P16083 231 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 G6PCP35575 357 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BCAP31P51572 246 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AKR1C2P52895 323 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SSX9Q7RTT3 188 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC35G3Q8N808 338 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LRTM2Q8N967 370 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IL22RA2Q969J5 263 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RITA1Q96K30 269 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CHIAQ9BZP6 476 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RAB18Q9NP72 206 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PDZD2O15018 2839 aa6.85□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VENTXO95231 258 aa6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FSHBP01225 129 aa6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGKV1-5P01602 117 aa6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM11P17152 192 aa6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LGALS7P47929 136 aa6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM177Q53S58 311 aa6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CFHR4Q92496 578 aa6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPR146Q96CH1 333 aa6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SEC22AQ96IW7 307 aa6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HARBI1Q96MB7 349 aa6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SSX3Q99909 188 aa6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COMMD9Q9P000 198 aa6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.84□□□□□ -1.31
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TACC2O95359 2948 aa6.83□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.83□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.83□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DBX1A6NMT0 343 aa6.83□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MARCH11A6NNE9 402 aa6.83□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PFDN1O60925 122 aa6.83□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SNAPC5O75971 98 aa6.83□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CXCL3P19876 107 aa6.83□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VDAC1P21796 283 aa6.83□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD83Q01151 205 aa6.83□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLGLAQ15195 96 aa6.83□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.83□□□□□ -1.32
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
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