RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528140.5

MYB-223, Transcript of MYB proto-oncogene, transcription factor, human

TSL 1 (best)

Gene MYB, Length 2,021 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYB-223	ENST00000528140	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	TEX38	Q6PEX7	206 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	SYS1	Q8N2H4	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	SPTSSA	Q969W0	71 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	SLC35E1	Q96K37	410 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	SNX22	Q96L94	193 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	PRRT1	Q99946	306 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	LRRC30	A6NM36	301 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	PPIAL4D	F5H284	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140		H0YL77	283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	IFNL4	K9M1U5	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140		M0R135	149 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	MLNR	O43193	412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	CYB5A	P00167	134 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	HPRT1	P00492	218 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	VSIG8	P0DPA2	414 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	OR12D2	P58182	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	TAS2R31	P59538	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	HILS1	P60008	231 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	ZNF616	Q08AN1	781 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	OR8S1	Q8NH09	359 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	TMEM106A	Q96A25	262 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	ZNF799	Q96GE5	643 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	SLC6A7	Q99884	636 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	RNF126	Q9BV68	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	ARV1	Q9H2C2	271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	NOX4	Q9NPH5	578 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140		U3KQE9	123 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140		H3BQ15	152 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	GYPB	P06028	91 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	SEC11B	P0C7V7	166 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	OR13C7	P0DN81	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	PTHLH	P12272	177 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	ERVFRD-1	P60508	538 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	UBE2G2	P60604	165 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	ZNF154	Q13106	437 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	CRMP1	Q14194	572 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	THRSP	Q92748	146 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	SEH1L	Q96EE3	360 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	RNF2	Q99496	336 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MYB-223	ENST00000528140	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MYB-223	ENST00000528140	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MYB-223	ENST00000528140	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MYB-223	ENST00000528140	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
MYB-223	ENST00000528140	CCL25	O15444	150 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MYB-223	ENST00000528140	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
MYB-223	ENST00000528140	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MYB-223	ENST00000528140	FSHB	P01225	129 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MYB-223	ENST00000528140	CTXN2	P0C2S0	81 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MYB-223	ENST00000528140	PGA5	P0DJD9	388 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MYB-223	ENST00000528140	CA6	P23280	308 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MYB-223	ENST00000528140	GATA4	P43694	442 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MYB-223	ENST00000528140	CAMLG	P49069	296 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MYB-223	ENST00000528140	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
MYB-223	ENST00000528140	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.64
MYB-223	ENST00000528140	ZNF85	Q03923	595 aa		4.84	□□□□□ -1.64

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