RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518858.1

CLVS1-204, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 2,980 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-204ENST00000518858 Q96M66 194 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 RARRES3Q9UL19 164 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 FAM166BA8MTA8 275 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SIRPB1O00241 398 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 PIAS2O75928 621 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 KITLGP21583 273 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SRPXP78539 464 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 TMEM52BQ4KMG9 183 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 CARD17Q5XLA6 110 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 Q6ZRM9 215 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SFTPA2Q8IWL1 248 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 ASB10Q8WXI3 467 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 TMEM186Q96B77 213 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 DGAT2Q96PD7 388 aa6.92□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 OR7C2O60412 319 aa6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 CA2P00918 260 aa6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 DDIT4LQ96D03 193 aa6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 BMFQ96LC9 184 aa6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SGCZQ96LD1 299 aa6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 VDAC1P21796 283 aa6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 COL8A2P25067 703 aa6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 PRRX1P54821 245 aa6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 TGFBR3Q03167 851 aa6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 STUMQ69YW2 141 aa6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 FAM58AQ8N1B3 248 aa6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SAP25Q8TEE9 199 aa6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 PATE1Q8WXA2 126 aa6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 PSENENQ9NZ42 101 aa6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 F5H5K5 113 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 VENTXO95231 258 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 PPOXP50336 477 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SERF2P84101 59 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 DNM1P34Q6PK57 102 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 Q6ZSR6 202 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 OR5D13Q8NGL4 314 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 OR51H1Q8NH63 302 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
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CLVS1-204ENST00000518858 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 GJE1A6NN92 205 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 AHRRA9YTQ3 701 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 GP1BBP13224 206 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 PRR31Q5SQ13 230 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 PLCXD3Q63HM9 321 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 VASH2Q86V25 355 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.9□□□□□ -1.3
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CLVS1-204ENST00000518858 ACACBO00763 2458 aa6.9□□□□□ -1.3
CLVS1-204ENST00000518858 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa6.9□□□□□ -1.31
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CLVS1-204ENST00000518858 TOX4O94842 621 aa6.9□□□□□ -1.31
CLVS1-204ENST00000518858 MT-ATP6P00846 226 aa6.9□□□□□ -1.31
CLVS1-204ENST00000518858 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.9□□□□□ -1.31
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CLVS1-204ENST00000518858 Q0VG73 95 aa6.9□□□□□ -1.31
CLVS1-204ENST00000518858 PSG7Q13046 419 aa6.9□□□□□ -1.31
CLVS1-204ENST00000518858 DOK3Q7L591 496 aa6.9□□□□□ -1.31
CLVS1-204ENST00000518858 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.9□□□□□ -1.31
CLVS1-204ENST00000518858 KCNS1Q96KK3 526 aa6.9□□□□□ -1.31
CLVS1-204ENST00000518858 GPR27Q9NS67 375 aa6.9□□□□□ -1.31
CLVS1-204ENST00000518858 TPRP12270 2363 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
CLVS1-204ENST00000518858 LAMA5O15230 3695 aa6.89□□□□□ -1.31
CLVS1-204ENST00000518858 PTPRBP23467 1997 aa6.89□□□□□ -1.31
CLVS1-204ENST00000518858 G3V4G9 280 aa6.89□□□□□ -1.31
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