RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	C11orf94	C9JXX5	98 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746		F6UZH7	168 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SIRPB1	O00241	398 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	PDE6D	O43924	150 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SOX15	O60248	233 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	NUPR1	O60356	82 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	WDR1	O75083	606 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAPPC6A	O75865	159 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	S1PR2	O95136	353 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SYNGR4	O95473	234 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TUBG1	P23258	451 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CA6	P23280	308 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	GDF1	P27539	372 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CD82	P27701	267 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CHRNA7	P36544	502 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	MPL	P40238	635 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CXCL12	P48061	93 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TDGF1P3	P51864	188 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SOX8	P57073	446 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	PPP1CB	P62140	327 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TLE1	Q04724	770 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746		Q8IYB0	196 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	OR2M7	Q8NG81	312 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	OR1L1	Q8NH94	360 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	DTD1	Q8TEA8	209 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	RAB1C	Q92928	201 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	HES4	Q9HCC6	221 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CLN8	Q9UBY8	286 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	NAGK	Q9UJ70	344 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	WASF3	Q9UPY6	502 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746		X6R8D5	127 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A1B0GUS0	222 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746		M0R143	59 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	NEURL1	O76050	574 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	KRAS	P01116	189 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	HBZ	P02008	142 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CRYAA	P02489	173 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	C1QTNF9	P0C862	333 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TDGF1	P13385	188 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CCNO	P22674	350 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	GCH1	P30793	250 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	OR10J1	P30954	320 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	OTX2	P32243	289 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	G6PC	P35575	357 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP5G3	P48201	142 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CYB561	P49447	251 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TMPRSS3	P57727	454 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	PMP22	Q01453	160 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	PLP2	Q04941	152 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	GABRA6	Q16445	453 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	DCAF10	Q5QP82	559 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM78B	Q5VT40	261 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	PMS2CL	Q68D20	193 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746		Q6ZWC4	215 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	MDP1	Q86V88	176 aa		4.13	□□□□□ -1.75

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