RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 FAM24BQ8N5W8 94 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 LZICQ8WZA0 190 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 DNAJC30Q96LL9 226 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 PBDC1Q9BVG4 233 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM138Q9NPI0 162 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 SPANXA1Q9NS26 97 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 ACER3Q9NUN7 267 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 TBX21Q9UL17 535 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 SSR3Q9UNL2 185 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-215ENST00000506510 ARAP3Q8WWN8 1544 aa3.09□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 A0A1W2PP18 115 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 A0A1W2PRE2 83 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 NKX2-6A6NCS4 301 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 A8MT66 165 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 H7C1C5 153 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 PFDN1O60925 122 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 OR56A5P0C7T3 313 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 NCALDP61601 193 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 LCN6P62502 163 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 DEFA6Q01524 100 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 CAV1Q03135 178 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 MMDQ15546 238 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 TOMM20LQ6UXN7 152 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 LINC01551Q86U37 167 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF664Q8N3J9 261 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 OR10G2Q8NGC3 310 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 OR5W2Q8NH69 310 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 MAL2Q969L2 176 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 GPR146Q96CH1 333 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 TRIB3Q96RU7 358 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 CCL13Q99616 98 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 CGREF1Q99674 301 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 COMMD5Q9GZQ3 224 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 KCNIP2Q9NS61 270 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 SLC23A2Q9UGH3 650 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 RTL1A6NKG5 1358 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 ROBO3Q96MS0 1386 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 MIA2Q96PC5 1412 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 SETD5Q9C0A6 1442 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 KMT2EQ8IZD2 1858 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 C11orf94C9JXX5 98 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 NDUFC2O95298 119 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF682O95780 498 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 HLA-DQA1P01909 254 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 C8GP07360 202 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF806P0C7X5 589 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 SRP9P49458 86 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 CCR6P51684 374 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 GNA12Q03113 381 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 SYCNQ0VAF6 134 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF678Q5SXM1 525 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 MKXQ8IYA7 352 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF561Q8N587 486 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 OR4A5Q8NH83 315 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 FRZBQ92765 325 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 PYURFQ96I23 114 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 NMNAT3Q96T66 252 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 TSC22D3Q99576 134 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 EFCAB11Q9BUY7 163 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 TSSK6Q9BXA6 273 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 IFI27L2Q9H2X8 130 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 GPR84Q9NQS5 396 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 C21orf62Q9NYP8 219 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 TAAR3PQ9P1P4 343 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 HECW2Q9P2P5 1572 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 NAV1Q8NEY1 1877 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 A0A1W2PQ67 120 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM223A0PJW6 202 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 SIGLEC16A6NMB1 481 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 E7EQ34 232 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 SLC17A3O00476 420 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 PIRO00625 290 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 COX7A2LO14548 114 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 NDUFA2O43678 99 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 TGFBR1P36897 503 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 CDC42P60953 191 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 GNB2P62879 340 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 CST6Q15828 149 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 GRK1Q15835 563 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 KLHL12Q53G59 568 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 TIFABQ6ZNK6 161 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-215ENST00000506510 SLC22A24Q8N4F4 322 aa3.06□□□□□ -1.92
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