RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 Q9N2K0 584 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 BABAM2Q9NXR7 383 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 ORC6Q9Y5N6 252 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 J3QLW9 94 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 EI24O14681 340 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 MAS1P04201 325 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 MGMTP16455 207 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF19P17023 458 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 ARL6IP1Q15041 203 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 TRAM1Q15629 374 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 VMA21Q3ZAQ7 101 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 MMD2Q8IY49 270 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 TSPAN14Q8NG11 270 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 ABHD14BQ96IU4 210 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 RNF126Q9BV68 326 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 FBXL15Q9H469 300 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 PFDN2Q9UHV9 154 aa5.75□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 HYDINQ4G0P3 5121 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 MITFO75030 526 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 DFFBO76075 338 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 ATP6V1E1P36543 226 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 RTL8BQ17RB0 113 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 ECSCRQ19T08 205 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 BATF2Q8N1L9 274 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF383Q8NA42 475 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 VSTM2AQ8TAG5 236 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 CYGBQ8WWM9 190 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 CXorf58Q96LI9 332 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 SPIN2AQ99865 258 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM127O75204 238 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 CDK2AP2O75956 126 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 SCTP09683 121 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 ARPC4P59998 168 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 LYG2Q86SG7 212 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 OR52L2PQ8NGH6 319 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 OR1L6Q8NGR2 347 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 DERL3Q96Q80 235 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 PEX16Q9Y5Y5 336 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.74□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 OR11H12B2RN74 326 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 TRDCB7Z8K6 153 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 DHFRP00374 187 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 CD74P04233 296 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 GSTT2P0CG29 244 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 GSTT2BP0CG30 244 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 SNU13P55769 128 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 SPSB3Q6PJ21 355 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 NR2C2APQ86WQ0 139 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 FKBP14Q9NWM8 211 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 APLNQ9ULZ1 77 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 A0A1W2PPE3 182 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 PROP1O75360 226 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 GNMTQ14749 295 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 FAM106AQ4KMX7 169 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 MS4A15Q8N5U1 240 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 OR5D18Q8NGL1 313 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 TXN2Q99757 166 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 C9orf16Q9BUW7 83 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 TMED9Q9BVK6 235 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 FCN1O00602 326 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 RPS16P62249 146 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 OXA1LQ15070 435 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 PACRGLQ8N7B6 248 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 ZBTB34Q8NCN2 500 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 LFNGQ8NES3 379 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 CLUHP3Q96NS8 147 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 NEDD4LQ96PU5 975 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 TBX5Q99593 518 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-210ENST00000503258 VCX3AQ9NNX9 186 aa5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms