RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490081.5

HDAC1-210, Transcript of histone deacetylase 1, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC1, Length 1,047 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1-210ENST00000490081 SLC6A1P30531 599 aa9.96□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 BTCP35070 178 aa9.96□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 IFITM3Q01628 133 aa9.96□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 CBX3Q13185 183 aa9.96□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 C11orf88Q6PI97 169 aa9.96□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa9.96□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 C5orf66Q9H5L9 145 aa9.96□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 PLEKHA2Q9HB19 425 aa9.96□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 COPZ2Q9P299 210 aa9.96□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 ATRQ13535 2644 aa9.96□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 H7C2Y5 167 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 TSPAN9O75954 239 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 NDUFA7O95182 113 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 HPRT1P00492 218 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 IGKV1-16P04430 117 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 FGF2P09038 288 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 PGAM2P15259 253 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 RPA2P15927 270 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 TMEM11P17152 192 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 CD24P25063 80 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 PIGPP57054 158 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 LINC00205P59089 165 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 HES1Q14469 280 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 POU2AF1Q16633 256 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 ABCA11PQ4W5N1 156 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 MZT2BQ6NZ67 158 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 Q8N2B8 174 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 POC5Q8NA72 575 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 DUSP18Q8NEJ0 188 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 OR4S2Q8NH73 311 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 GALNT14Q96FL9 552 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 SLC25A33Q9BSK2 321 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 TBC1D24Q9ULP9 559 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 MOB4Q9Y3A3 225 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 FBN3Q75N90 2809 aa9.95□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa9.94□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 CHST1O43916 411 aa9.94□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 AMY1AP04745 511 aa9.94□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 DHODHQ02127 395 aa9.94□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 ZNF585BQ52M93 769 aa9.94□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 TMEM128Q5BJH2 165 aa9.94□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 TBC1D26Q86UD7 250 aa9.94□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 SPAG16Q8N0X2 631 aa9.94□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 C5orf56Q8N8D9 126 aa9.94□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 TEX45Q8NA69 505 aa9.94□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa9.94□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 C16orf95Q9H693 158 aa9.94□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 COMMD9Q9P000 198 aa9.94□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 VSIG4Q9Y279 399 aa9.94□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa9.93□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 FAM181BA6NEQ2 426 aa9.93□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 H0Y980 276 aa9.93□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 RRHO14718 337 aa9.93□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 NBR2O15453 112 aa9.93□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 FCGR3BO75015 233 aa9.93□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 HRASP01112 189 aa9.93□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 IGLV2-23P01705 113 aa9.93□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 RLN1P04808 185 aa9.93□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 CRYGBP07316 175 aa9.93□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
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HDAC1-210ENST00000490081 F2RL1P55085 397 aa9.93□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 TAS2R31P59538 309 aa9.93□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 DEFA1P59665 94 aa9.93□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 DEFA3P59666 94 aa9.93□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 RPS16P62249 146 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 HNF4GQ14541 408 aa9.93□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 LY6EQ16553 131 aa9.93□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 PHLDA2Q53GA4 152 aa9.93□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 FBLN7Q53RD9 439 aa9.93□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 SLC25A42Q86VD7 318 aa9.93□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 Q8N9W7 124 aa9.93□□□□□ -0.82
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HDAC1-210ENST00000490081 ZNF580Q9UK33 172 aa9.93□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa9.93□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa9.92□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 A0A1B0GUS0 222 aa9.92□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 TNFSF12O43508 249 aa9.92□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 CDS2O95674 445 aa9.92□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 CRYZL1O95825 349 aa9.92□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 HLA-DRB1P01911 266 aa9.92□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 TCRBP04435 133 aa9.92□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 CRYBA1P05813 215 aa9.92□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 HKR1P10072 659 aa9.92□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 PI3P19957 117 aa9.92□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 UCP1P25874 307 aa9.92□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 CCR6P51684 374 aa9.92□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 RAG2P55895 527 aa9.92□□□□□ -0.82
HDAC1-210ENST00000490081 UBE2KP61086 200 aa9.92□□□□□ -0.82
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