RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489390.1

SHOC2-205, Transcript of SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein, human

TSL 5

Gene SHOC2, Length 815 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHOC2-205	ENST00000489390	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	MED22	Q15528	200 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	TNXA	Q16473	311 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	PRSS8	Q16651	343 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	TMEM177	Q53S58	311 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF575	Q86XF7	245 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	CDH26	Q8IXH8	852 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	MED4	Q9NPJ6	270 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390		M0R1X1	148 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	SHOX	O15266	292 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	CBX3	Q13185	183 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	XAF1	Q6GPH4	301 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	TEX45	Q8NA69	505 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	POMP	Q9Y244	141 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	SCT	P09683	121 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	SETD6	Q8TBK2	473 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	CCDC140	Q96MF4	163 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	SPIN2A	Q99865	258 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	HERC1	Q15751	4861 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	TSPAN4	O14817	238 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	GAL	P22466	123 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	UBE2K	P61086	200 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390		Q499Y3	187 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF585B	Q52M93	769 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	OR11H2	Q8NH07	326 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	CSTL1	Q9H114	145 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	GHRL	Q9UBU3	117 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	MPTX1	A8MV57	137 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	DYNC1I1	O14576	645 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	CDK2AP2	O75956	126 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	S1PR2	O95136	353 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	IGHV3-23	P01764	117 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	LIMS3	P0CW19	117 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	LIMS4	P0CW20	117 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	ADM	P35318	185 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	GYS2	P54840	703 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	HLA-DRB3	P79483	266 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	RTL8B	Q17RB0	113 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	SETD9	Q8NE22	299 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	SMIM19	Q96E16	107 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	HRH4	Q9H3N8	390 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	AASS	Q9UDR5	926 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SHOC2-205	ENST00000489390	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	OGG1	O15527	345 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	ACTL6B	O94805	426 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	RRAS	P10301	218 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	MYOD1	P15172	320 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	GABRB1	P18505	474 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	OR5B3	Q8NH48	314 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	RDH8	Q9NYR8	311 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		10.39	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	OR4C46	A6NHA9	309 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	PSMB6	P28072	239 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	MED21	Q13503	144 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	TPBG	Q13641	420 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390		Q96MT0	163 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75

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