RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 IGKV1D-39P04432 117 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 GNB1P62873 340 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 DCAF12Q5T6F0 453 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 CACNA1DQ01668 2161 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 CBY3A6NI87 242 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 PMCHP20382 165 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 IER3P46695 156 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 ZXDAP98168 799 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 TFF3Q07654 80 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 PRDX4Q13162 271 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 APH1AQ96BI3 265 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 SIRPB1O00241 398 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 SLC17A3O00476 420 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 SH2D1BO14796 132 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 CYB561P49447 251 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 FOXL1Q12952 345 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 TMEM42Q69YG0 159 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 C20orf204Q6ZNR8 217 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 TMEM144Q7Z5S9 345 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 ATOH7Q8N100 152 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 OR4B1Q8NGF8 309 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 KCNE4Q8WWG9 221 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 IL36GQ9NZH8 169 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 CLN8Q9UBY8 286 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 WNT2P09544 360 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 AMTP48728 403 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 GFRA1P56159 465 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 SPINK9Q5DT21 86 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 WNT10AQ9GZT5 417 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 OR1A1Q9P1Q5 309 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 FBXL7Q9UJT9 491 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 RNF24Q9Y225 148 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 NDUFB8O95169 186 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 OR10P1Q8NGE3 313 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 OR5P3Q8WZ94 311 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 A0A1W2PPV4 95 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 TRAPPC2LH3BP13 241 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 SELENOTP62341 195 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 GCSAMLQ5JQS6 135 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 C1orf210Q8IVY1 113 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 OR10G8Q8NGN5 311 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 UQCR10Q9UDW1 63 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 FAM166BA8MTA8 275 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 SLC25A6P12236 298 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 LINC00310P59036 64 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 IGFBP7Q16270 282 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 C3AR1Q16581 482 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 KIAA1644Q3SXP7 199 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 PCSK4Q6UW60 755 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 OR4C5Q8NGB2 326 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 ZNF488Q96MN9 340 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 NKX6-3A6NJ46 265 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 SNURFLB1AK76 121 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 MLNRO43193 412 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 DNPH1O43598 174 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 LHX2P50458 406 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 ATP6V1FQ16864 119 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 MKXQ8IYA7 352 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 FGFRL1Q8N441 504 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 RNF2Q99496 336 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 RNF114Q9Y508 228 aa11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 DSPP15924 2871 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
NISCH-212ENST00000488380 PDE6DO43924 150 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-212ENST00000488380 EDDM3BP56851 147 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-212ENST00000488380 ARF1P84077 181 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-212ENST00000488380 TGFBR3Q03167 851 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-212ENST00000488380 ERASQ7Z444 233 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-212ENST00000488380 TUSC5Q8IXB3 177 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-212ENST00000488380 OR1L1Q8NH94 360 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-212ENST00000488380 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-212ENST00000488380 TMEM147Q9BVK8 224 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-212ENST00000488380 PRRG4Q9BZD6 226 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-212ENST00000488380 R4GN57 208 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-212ENST00000488380 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-212ENST00000488380 C19orf67A6NJJ6 358 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-212ENST00000488380 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-212ENST00000488380 CD99P14209 185 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-212ENST00000488380 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-212ENST00000488380 LYG1Q8N1E2 194 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-212ENST00000488380 OR56B2PQ8NGI1 322 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-212ENST00000488380 VPS25Q9BRG1 176 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-212ENST00000488380 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-212ENST00000488380 TIMM9Q9Y5J7 89 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-212ENST00000488380 C9orf172C9J069 976 aa11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.5 ms