RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 AMY2BP19961 511 aa6.46□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 TNFSF4P23510 183 aa6.46□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 NECAP1Q8NC96 275 aa6.46□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.46□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 OR4F4Q96R69 305 aa6.46□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 ABHD6Q9BV23 337 aa6.46□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
USP4-211ENST00000485450 A0A0A6YYD4 124 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 A0A1B0GV72 72 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 H7BYZ3 331 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 TNFSF11O14788 317 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 ST8SIA3O43173 380 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 ESDP10768 282 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 AZU1P20160 251 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 PRR27Q6MZM9 219 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 APH1AQ96BI3 265 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 GNG13Q9P2W3 67 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 B9D1Q9UPM9 204 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 PDZD2O15018 2839 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 K7ERU9 68 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 RAD51DO75771 328 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 TPPP2P59282 170 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 SLC22A24Q8N4F4 322 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 LRTM2Q8N967 370 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 RND1Q92730 232 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 MBD6Q96DN6 1003 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 PRSS50Q9UI38 385 aa6.46□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 ARID1AO14497 2285 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 GAGE12BA1L429 117 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 CDIPTO14735 213 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 CTXN1P60606 82 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 LCN2P80188 198 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 CST9LP1Q5W188 147 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 SPSB1Q96BD6 273 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 CXXC4Q9H2H0 198 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 TMEM38BQ9NVV0 291 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 PF4P02776 101 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 DUSP1P28562 367 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 FOXF2Q12947 444 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 ADIRFQ15847 76 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 SLC18B1Q6NT16 456 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 WDR82Q6UXN9 313 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 Q6ZSR3 168 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 BATF2Q8N1L9 274 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 DECR2Q9NUI1 292 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 H7C1C5 153 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 SOCS1O15524 211 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 RENP00797 406 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 CCL2P13500 99 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 GCH1P30793 250 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 LCN6P62502 163 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 TMEM177Q53S58 311 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 ALG10Q5BKT4 473 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 LINC00346Q8IVM7 164 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 TMEM171Q8WVE6 324 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 NABP1Q96AH0 204 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 C18orf12Q96KH6 178 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.45□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 FBN2P35556 2912 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.383e-6■■■■□ 21.5
USP4-211ENST00000485450 LMX1BO60663 402 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 THBDP07204 575 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 H2BFMP0C1H6 154 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 CRYGSP22914 178 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 ZNF83P51522 516 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 TMEM50BP56557 158 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 TMEM187Q14656 261 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 GNMTQ14749 295 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 RAET1LQ5VY80 246 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 TSPAN32Q96QS1 320 aa6.44□□□□□ -1.38
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