RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478080.5

CDHR3-211, Transcript of cadherin related family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CDHR3, Length 2,633 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3-211ENST00000478080 RPS23P62266 143 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CDHR3-211ENST00000478080 HBG1P69891 147 aa7.34□□□□□ -1.23
CDHR3-211ENST00000478080 HBG2P69892 147 aa7.34□□□□□ -1.23
CDHR3-211ENST00000478080 ADIPOQQ15848 244 aa7.34□□□□□ -1.23
CDHR3-211ENST00000478080 CR1LQ2VPA4 569 aa7.34□□□□□ -1.23
CDHR3-211ENST00000478080 CT45A1Q5HYN5 189 aa7.34□□□□□ -1.23
CDHR3-211ENST00000478080 AVPI1Q5T686 147 aa7.34□□□□□ -1.23
CDHR3-211ENST00000478080 STUMQ69YW2 141 aa7.34□□□□□ -1.23
CDHR3-211ENST00000478080 TRAT1Q6PIZ9 186 aa7.34□□□□□ -1.23
CDHR3-211ENST00000478080 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.34□□□□□ -1.23
CDHR3-211ENST00000478080 CT45A3Q8NHU0 189 aa7.34□□□□□ -1.23
CDHR3-211ENST00000478080 DTD1Q8TEA8 209 aa7.34□□□□□ -1.23
CDHR3-211ENST00000478080 C14orf79Q96F83 325 aa7.34□□□□□ -1.23
CDHR3-211ENST00000478080 GAFA1Q96PS6 74 aa7.34□□□□□ -1.23
CDHR3-211ENST00000478080 YPEL2Q96QA6 119 aa7.34□□□□□ -1.23
CDHR3-211ENST00000478080 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CDHR3-211ENST00000478080 JPT1Q9UK76 154 aa7.34□□□□□ -1.23
CDHR3-211ENST00000478080 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
CDHR3-211ENST00000478080 TACC2O95359 2948 aa7.34□□□□□ -1.23
CDHR3-211ENST00000478080 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa7.34□□□□□ -1.23
CDHR3-211ENST00000478080 DSCAML1Q8TD84 2053 aa7.34□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 A0A1W2PR64 198 aa7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 A0A1W2PRV1 198 aa7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 CEBPZOSA8MTT3 80 aa7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 K7ENP7 123 aa7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 RAB29O14966 203 aa7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 GNG10P50151 68 aa7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 S100A12P80511 92 aa7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF561Q8N587 486 aa7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 LFNGQ8NES3 379 aa7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 FAM222BQ8WU58 562 aa7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 NEUROG1Q92886 237 aa7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 FAM90A26D6RGX4 464 aa7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 F2RL2O00254 374 aa7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 PPIHO43447 177 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 TLE4Q04727 773 aa7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 ICAM4Q14773 271 aa7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 GNG13Q9P2W3 67 aa7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 ZZEF1O43149 2961 aa7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 TMPRSS2O15393 492 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 IGKV1D-33P01593 117 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 IGKV1-33P01594 117 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 IFNA4P05014 189 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 DEFA4P12838 97 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 TFF3Q07654 80 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 SOHLH1Q5JUK2 328 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 NUP37Q8NFH4 326 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 CLDND2Q8NHS1 167 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 SDSLQ96GA7 329 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF665Q9H7R5 613 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 OR6C3Q9NZP0 311 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 KIAA1456Q9P272 454 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF835Q9Y2P0 537 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 TANC2Q9HCD6 1990 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 A0A1W2PPE2 198 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 A0A1W2PPH5 198 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 ZFP92A6NM28 416 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF727A8MUV8 499 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 FCN3O75636 299 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 IFNA17P01571 189 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 SRP19P09132 144 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 TNFSF4P23510 183 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 PTAFRP25105 342 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 RAB2AP61019 212 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF788Q6ZQV5 615 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 ELOVL5Q9NYP7 299 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 JKAMPQ9P055 326 aa7.32□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa7.31□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 A0A1B0GW64 132 aa7.31□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 C17orf100A8MU93 164 aa7.31□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 NDUFB7P17568 137 aa7.31□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 COL8A2P25067 703 aa7.31□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 ACSM6Q6P461 480 aa7.31□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 LYG1Q8N1E2 194 aa7.31□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.31□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 HPRT1P00492 218 aa7.31□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 IRF2P14316 349 aa7.31□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 MYOD1P15172 320 aa7.31□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF787Q6DD87 383 aa7.31□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.31□□□□□ -1.24
CDHR3-211ENST00000478080 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms