RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473778.5

C9orf3-214, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 2,396 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-214ENST00000473778 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 TMEM164Q5U3C3 297 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 C1orf87Q8N0U7 546 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 Q8N7P7 452 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 OR13D1Q8NGV5 346 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 GALMQ96C23 342 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 P2RX4Q99571 388 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 HIST1H2BLQ99880 126 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 CDH20Q9HBT6 801 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 FAM90A26D6RGX4 464 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 M0R143 59 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 DVL1O14640 695 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 PROP1O75360 226 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 NPSP0C0P6 89 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 RAC2P15153 192 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 GZMHP20718 246 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 GAGE1Q13065 139 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 GABRA6Q16445 453 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 NECAP1Q8NC96 275 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 OR13A1Q8NGR1 328 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 RFESDQ8TAC1 157 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 PLPPR2Q96GM1 343 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 SNX22Q96L94 193 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 ELOVL1Q9BW60 279 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 OBP2BQ9NPH6 170 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 SLC39A9Q9NUM3 307 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 MGAQ8IWI9 3026 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 CACNA1GO43497 2377 aa9.14□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 GZMBP10144 247 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 TDGF1P3P51864 188 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 ADIRFQ15847 76 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 WDR82Q6UXN9 313 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 C16orf82Q7Z2V1 217 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 AGMATQ9BSE5 352 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 MSL2Q9HCI7 577 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 PFN1P07737 140 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 CD46P15529 392 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 NPPCP23582 126 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 GABRA2P47869 451 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 ARG2P78540 354 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 CLEC12BQ2HXU8 276 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 VWA1Q6PCB0 445 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 ACP7Q6ZNF0 438 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 CLCF1Q9UBD9 225 aa9.13□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 J3QW42 95 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 BMP5P22003 454 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 PRSS8Q16651 343 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 UTF1Q5T230 341 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 HES3Q5TGS1 186 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 OR4X1Q8NH49 305 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 PARLQ9H300 379 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 ASCL3Q9NQ33 180 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 OOEPA6NGQ2 149 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 KBTBD11O94819 623 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 PMS2P11Q13670 270 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 GUSBP1Q15486 140 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 FFAR4Q5NUL3 377 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 NCR3LG1Q68D85 454 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 SLC35E4Q6ICL7 350 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 WDR31Q8NA23 367 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 OR51G1Q8NGK1 321 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 OR10G9Q8NGN4 311 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 OR10G7Q8NGN6 311 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 KCNIP1Q9NZI2 227 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 NAT8Q9UHE5 227 aa9.12□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 ICE1Q9Y2F5 2266 aa9.11□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 RNF212BA8MTL3 300 aa9.11□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 IGKV3-15P01624 115 aa9.11□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 OPN1MWP04001 364 aa9.11□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 OR9G9P0C7N8 305 aa9.11□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 OPN1MW2P0DN77 364 aa9.11□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 OPN1MW3P0DN78 364 aa9.11□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 COL10A1Q03692 680 aa9.11□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 LTC4SQ16873 150 aa9.11□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 PLA2G2CQ5R387 149 aa9.11□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 Q6ZT83 130 aa9.11□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 CD177Q8N6Q3 437 aa9.11□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 Q8TCH9 128 aa9.11□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa9.11□□□□□ -0.95
C9orf3-214ENST00000473778 TRIB1Q96RU8 372 aa9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms