RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 GUCA1BQ9UMX6 200 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-207ENST00000470201 SNX12Q9UMY4 172 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-207ENST00000470201 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-207ENST00000470201 COL18A1P39060 1754 aa2.28□□□□□ -2.04
RABGGTB-207ENST00000470201 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 SDK2Q58EX2 2172 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 DSCAML1Q8TD84 2053 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 GRIFINA4D1Z8 144 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 E5RI56 91 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 E7EQL1 145 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC17A3O00476 420 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 RAB14P61106 215 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 PSG4Q00888 419 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 RSU1Q15404 277 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 BATFQ16520 125 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 PLPPR5Q32ZL2 321 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM229BQ4G0N7 80 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 OR10K2Q6IF99 312 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 SBSNQ6UWP8 590 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 AMTNQ6UX39 209 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC121Q6ZUS5 278 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 LRRC34Q8IZ02 419 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 UBL4BQ8N7F7 174 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 C16orf78Q8WTQ4 265 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 C16orf95Q9H693 158 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC2A9Q9NRM0 540 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC22A13Q9Y226 551 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 V9GYQ6 96 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 MAPKBP1O60336 1514 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 ATAD5Q96QE3 1844 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 KIF15Q9NS87 1388 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 CACNA1AO00555 2505 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 C19orf71A6NCJ1 209 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 OR6C6A6NF89 314 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 C17orf51A8MQB3 221 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 EVPLLA8MZ36 301 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 H3BQV1 296 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 HLA-DQB2P05538 268 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 CRYBB3P26998 211 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 CCR7P32248 378 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 TCL1AP56279 114 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 AP3S2P59780 193 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 NAA20P61599 178 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 C1orf194Q5T5A4 169 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 BRD3OSQ6XYD6 125 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 HIST2H3AQ71DI3 136 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 CAPZA3Q96KX2 299 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 STACQ99469 402 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 AICDAQ9GZX7 198 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 STOML2Q9UJZ1 356 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF337Q9Y3M9 751 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 SCRIBQ14160 1630 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 KIF21BO75037 1637 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 DISC1C4P0D8 188 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNK1O00180 336 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 APOMO95445 188 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 SOD1P00441 154 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 CTXN2P0C2S0 81 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 CCL3P10147 92 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 CPMP14384 443 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 CRHBPP24387 322 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 REG1BP48304 166 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 RWDD2BP57060 319 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 ARPC4P59998 168 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 GLO1Q04760 184 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 ACSM3Q53FZ2 586 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 SFXN4Q6P4A7 337 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 SMARCD3Q6STE5 483 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 PP632Q6XCG6 107 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 OR4K13Q8NH42 304 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 ASB17Q8WXJ9 295 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 OR51I1Q9H343 314 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 SMARCA4P51532 1647 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 HMGXB3Q12766 1538 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM114B3SHH9 223 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 UBE2L6O14933 153 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 NDUFB2O95178 105 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 IFNA6P05013 189 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 RPSAP08865 295 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 UCHL3P15374 230 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 CD200P41217 278 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-207ENST00000470201 CDK9P50750 372 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms