RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 OR52A1Q9UKL2 312 aa4.96□□□□□ -1.61
PTPRR-204ENST00000440835 DOCK11Q5JSL3 2073 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRR-204ENST00000440835 TRAV40A0A0B4J280 105 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRR-204ENST00000440835 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRR-204ENST00000440835 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
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PTPRR-204ENST00000440835 ZNF343Q6P1L6 599 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRR-204ENST00000440835 HIPK2Q9H2X6 1198 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRR-204ENST00000440835 IGHV1-69P01742 117 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRR-204ENST00000440835 Q8WTZ3 238 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRR-204ENST00000440835 S100A13Q99584 98 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRR-204ENST00000440835 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRR-204ENST00000440835 JAGN1Q8N5M9 183 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRR-204ENST00000440835 OR13C8Q8NGS7 320 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRR-204ENST00000440835 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRR-204ENST00000440835 ABHD5Q8WTS1 349 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRR-204ENST00000440835 C15orf40Q8WUR7 153 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRR-204ENST00000440835 PGAM5Q96HS1 289 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRR-204ENST00000440835 SLC25A31Q9H0C2 315 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRR-204ENST00000440835 SIRPDQ9H106 197 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRR-204ENST00000440835 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRR-204ENST00000440835 RNF114Q9Y508 228 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRR-204ENST00000440835 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRR-204ENST00000440835 IER3P46695 156 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRR-204ENST00000440835 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRR-204ENST00000440835 PPP1R1AQ13522 171 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRR-204ENST00000440835 BSXQ3C1V8 233 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRR-204ENST00000440835 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRR-204ENST00000440835 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRR-204ENST00000440835 NCR3LG1Q68D85 454 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRR-204ENST00000440835 Q6ZRG5 221 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRR-204ENST00000440835 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRR-204ENST00000440835 OR4K15Q8NH41 348 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRR-204ENST00000440835 LYPD6BQ8NI32 183 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRR-204ENST00000440835 C8orf46Q8TAG6 207 aa4.95□□□□□ -1.62
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