RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383974.1

RNU6-1040P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1040, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1040P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1040P-201ENST00000383974 C17orf78Q8N4C9 275 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 Q8N814 137 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OR11H6Q8NGC7 330 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OR13C8Q8NGS7 320 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OR51H1Q8NH63 302 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CHST6Q9GZX3 395 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SYT4Q9H2B2 425 aa-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GREB1Q4ZG55 1949 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NCR3O14931 201 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PPBPP02775 128 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CA7P43166 264 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 FXYD7P58549 80 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TMEM249Q2WGJ8 235 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GDF5OSQ5U4N7 250 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TESCQ96BS2 214 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ACY3Q96HD9 319 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 FLT4P35916 1363 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 A0A087WUU8 490 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 FABP7O15540 132 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ATP8B1O43520 1251 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SC5DO75845 299 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OR10J1P30954 320 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RCVRNP35243 200 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CDK9P50750 372 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 AQP5P55064 265 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RAB14P61106 215 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ACSM3Q53FZ2 586 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 LINC00523Q86TU6 105 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GNB1LQ9BYB4 327 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RGCCQ9H4X1 137 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 RMND1Q9NWS8 449 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 FAT1Q14517 4588 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SIPA1L1O43166 1804 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 IRGMA1A4Y4 181 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CLDN25C9JDP6 229 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 M0QYV0 167 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SPINK9Q5DT21 86 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DHFR2Q86XF0 187 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OR4A15Q8NGL6 344 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 OR5P2Q8WZ92 322 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MRAP2Q96G30 205 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NMNAT3Q96T66 252 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CISHQ9NSE2 258 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PEAK1Q9H792 1746 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 KIF24Q5T7B8 1368 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 A0A1B0GTQ1 180 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TRAPPC2LH3BP13 241 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 hCG_2039718K7EN88 272 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SHBGP04278 402 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SRMP19623 302 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 EFNA4P52798 201 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 HERVK_113P63121 156 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 ZNF846Q147U1 533 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CAVIN4Q5BKX8 364 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 C9orf64Q5T6V5 341 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PID1Q7Z2X4 250 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 BAP18Q8IXM2 172 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 LRRC34Q8IZ02 419 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SYS1Q8N2H4 156 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TOP1MTQ969P6 601 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 YIPF3Q9GZM5 350 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 NAT8Q9UHE5 227 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 SNX10Q9Y5X0 201 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DENND4CQ5VZ89 1909 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1040P-201ENST00000383974 EML6Q6ZMW3 1958 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CHD5Q8TDI0 1954 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1040P-201ENST00000383974 IGF2RP11717 2491 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1040P-201ENST00000383974 M0R2N4 97 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GPR171O14626 319 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TFPTP0C1Z6 253 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1040P-201ENST00000383974 BGNP21810 368 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1040P-201ENST00000383974 DEKP35659 375 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1040P-201ENST00000383974 PEX19P40855 299 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1040P-201ENST00000383974 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1040P-201ENST00000383974 FAM27BQ5VT28 67 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1040P-201ENST00000383974 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1040P-201ENST00000383974 FBXO44Q9H4M3 255 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1040P-201ENST00000383974 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1040P-201ENST00000383974 TMBIM4Q9HC24 238 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1040P-201ENST00000383974 IFT46Q9NQC8 304 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1040P-201ENST00000383974 STMN3Q9NZ72 180 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1040P-201ENST00000383974 KLK9Q9UKQ9 250 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1040P-201ENST00000383974 HERC2O95714 4834 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1040P-201ENST00000383974 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1040P-201ENST00000383974 GOLGA8IPA6NC78 632 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1040P-201ENST00000383974 EFCAB9A8MZ26 197 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1040P-201ENST00000383974 MRASO14807 208 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1040P-201ENST00000383974 KDELR3O43731 214 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1040P-201ENST00000383974 AP1S1P61966 158 aa-0.8□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms