RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377962.7

CNMD-201, Transcript of chondromodulin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNMD, Length 1,410 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNMD-201ENST00000377962 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 RPL30P62888 115 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 HES1Q14469 280 aa10□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 ABCA11PQ4W5N1 156 aa10□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 POC5Q8NA72 575 aa10□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 OR5AN1Q8NGI8 311 aa10□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 SLC25A33Q9BSK2 321 aa10□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 ZNF702PQ9H963 129 aa10□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 BEX1Q9HBH7 125 aa10□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 VSIG4Q9Y279 399 aa10□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 RNF114Q9Y508 228 aa10□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 H0YJW9 148 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 AMY1AP04745 511 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 CD1BP29016 333 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 SLC6A1P30531 599 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 THBS3P49746 956 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 PIGPP57054 158 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 DEFA1P59665 94 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 DEFA3P59666 94 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 ZNF66Q6ZN08 573 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 OR4C13Q8NGP0 309 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 ADTRPQ96IZ2 230 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 C5orf66Q9H5L9 145 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 C16orf95Q9H693 158 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 SLC2A9Q9NRM0 540 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 PITPNC1Q9UKF7 332 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 NDUFB6O95139 128 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 FAM106CPP0CH98 169 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 TMEM11P17152 192 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 S100GP29377 79 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 MC5RP33032 325 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 TMEM95Q3KNT9 176 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 KCTD9Q7L273 389 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 TBC1D26Q86UD7 250 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 THNSL2Q86YJ6 484 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 OR51H1Q8NH63 302 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 WFDC12Q8WWY7 111 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 DDB2Q92466 427 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 ZNF747Q9BV97 191 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 RAB18Q9NP72 206 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 PALMDQ9NP74 551 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 COPZ2Q9P299 210 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 MMP24Q9Y5R2 645 aa9.99□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 TENM1Q9UKZ4 2725 aa9.98□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 STAB1Q9NY15 2570 aa9.98□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 H7C2Y5 167 aa9.98□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 MPPED1O15442 326 aa9.98□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 OR2F2O95006 317 aa9.98□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 TCRBP04435 133 aa9.98□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 RLN1P04808 185 aa9.98□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 PROK1P58294 105 aa9.98□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 RND3P61587 244 aa9.98□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 CATR1Q13166 79 aa9.98□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 OR2B11Q5JQS5 317 aa9.98□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 TMED4Q7Z7H5 227 aa9.98□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa9.98□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 RITA1Q96K30 269 aa9.98□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 SLC35D1Q9NTN3 355 aa9.98□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 FLVCR2Q9UPI3 526 aa9.98□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa9.98□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 WASHC3Q9Y3C0 194 aa9.98□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 FCGR3BO75015 233 aa9.97□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 MOSP00540 346 aa9.97□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 APOA2P02652 100 aa9.97□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 AKR1C4P17516 323 aa9.97□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 F2RP25116 425 aa9.97□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 BRWD1-AS2P59051 145 aa9.97□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 EBI3Q14213 229 aa9.97□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 RTL8BQ17RB0 113 aa9.97□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 NRARPQ7Z6K4 114 aa9.97□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 Q8N6K4 173 aa9.97□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 OR2T10Q8NGZ9 312 aa9.97□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 ENKURQ8TC29 256 aa9.97□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 SERTAD4Q9NUC0 356 aa9.97□□□□□ -0.81
CNMD-201ENST00000377962 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CNMD-201ENST00000377962 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CNMD-201ENST00000377962 IGKV1-16P04430 117 aa9.96□□□□□ -0.82
CNMD-201ENST00000377962 VSIG10L2P0DP72 767 aa9.96□□□□□ -0.82
CNMD-201ENST00000377962 RRASP10301 218 aa9.96□□□□□ -0.82
CNMD-201ENST00000377962 F2RL1P55085 397 aa9.96□□□□□ -0.82
CNMD-201ENST00000377962 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.96□□□□□ -0.82
CNMD-201ENST00000377962 PDPNQ86YL7 162 aa9.96□□□□□ -0.82
CNMD-201ENST00000377962 SPAG16Q8N0X2 631 aa9.96□□□□□ -0.82
CNMD-201ENST00000377962 Q8N2B8 174 aa9.96□□□□□ -0.82
CNMD-201ENST00000377962 CENPSQ8N2Z9 138 aa9.96□□□□□ -0.82
CNMD-201ENST00000377962 DUSP18Q8NEJ0 188 aa9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms