RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364771.1

RNU6-1187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1187P, Length 110 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1187P-201ENST00000364771 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 GPX1P07203 203 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 CRYGDP07320 174 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 CELA2AP08217 269 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 ELANEP08246 267 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 IL3P08700 152 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 HOXB7P09629 217 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 SEC11BP0C7V7 166 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 LINC00869P0C866 280 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 C8orf88P0DMB2 117 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 IRF1P10914 325 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 FABP2P12104 132 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 IL9P15248 144 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 CRISP2P16562 243 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 NPPBP16860 134 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 ZNF708P17019 499 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 ORM2P19652 201 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 MALP21145 153 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 EVI2AP22794 236 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 PPIBP23284 216 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 CBLN1P23435 193 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 EDNRAP25101 427 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 IL3RAP26951 378 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 CRYBB3P26998 211 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 AQP1P29972 269 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 GPR183P32249 361 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 S100A3P33764 101 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 FAUP35544 74 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 G6PCP35575 357 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 PLA2G5P39877 138 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 PNPLA4P41247 253 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 CA7P43166 264 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 SSR2P43308 183 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 CCL11P51671 97 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 EFNB2P52799 333 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 CRYBA2P53672 197 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 CCL23P55773 120 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 DLX6P56179 175 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 CLDN6P56747 220 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 FBXW4P57775 412 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 OR1D5P58170 312 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 LCN6P62502 163 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 RPL23P62829 140 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 RPS28P62857 69 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 HERVK_113P63121 156 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 RAE1P78406 368 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 CX3CL1P78423 397 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 CYCSP99999 105 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 ZNF85Q03923 595 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 FMODQ06828 376 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 Q0VG73 95 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 GAGE2BQ13066 116 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 MFAP5Q13361 173 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 C1orf61Q13536 156 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 PCOLCEQ15113 449 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 GUSBP1Q15486 140 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 ZNF141Q15928 474 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 TBR1Q16650 682 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 HLA-DRB5Q30154 266 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 MS4A18Q3C1V0 323 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 ZNF718Q3SXZ3 478 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 ETDBQ3ZM63 59 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 TMEM52BQ4KMG9 183 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 GAGE13Q4V321 117 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 GAGE2EQ4V326 116 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 Q56UQ5 140 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 SYT14P1Q58G82 188 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 NMSQ5H8A3 153 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 C6orf226Q5I0X4 101 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 ZNF506Q5JVG8 444 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 SPANXN4Q5MJ08 99 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 C6orf136Q5SQH8 315 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 SLC25A30Q5SVS4 291 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 Q5XG85 94 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 FAM90A2PQ658T7 463 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 TXNDC8Q6A555 127 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 EBLN2Q6P2I7 272 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 SLC25A34Q6PIV7 304 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 OPN5Q6U736 354 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 SBSNQ6UWP8 590 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 IGFL2Q6UWQ7 119 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 TMEM207Q6UWW9 146 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 TMEM64Q6YI46 380 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 Q6ZQT7 251 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 DNM1P46Q6ZS02 220 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 C2orf91Q6ZV80 131 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-1187P-201ENST00000364771 SMIM5Q71RC9 77 aa0.79□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms