RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.01□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 GAB2Q9UQC2 676 aa6.01□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.01□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 GABARAPH6UMI1 98 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 H7C2Y5 167 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 ATP6V0E1O15342 81 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 SSX5O60225 188 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFA3O95167 84 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 IGHG4P01861 327 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 ELANEP08246 267 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 CT45A6P0DMU7 189 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 CT45A5P0DMU8 189 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 CT45A7P0DMV0 189 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 NAT1P18440 290 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.452e-9■■□□□ 12.7
SGMS1-201ENST00000361543 HERV-K104P61576 105 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 CDK10Q15131 360 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 RTL8BQ17RB0 113 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 DEFB136Q30KP8 78 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 IGSF11Q5DX21 431 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 NPBQ8NG41 125 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 OR5H2Q8NGV7 314 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 MRAPQ8TCY5 172 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 GPX8Q8TED1 209 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 FCAMRQ8WWV6 532 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 RAX2Q96IS3 184 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 DUX3Q96PT4 197 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 RNF5Q99942 180 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 GPR61Q9BZJ8 451 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 OR51J1Q9H342 316 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 BATF3Q9NR55 127 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 ANAPC10Q9UM13 185 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV41A0A0B4J266 112 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 FABP12A6NFH5 140 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 G3V318 75 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 H0YJW9 148 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 CCL24O00175 119 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 RRHO14718 337 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 CTDSPLO15194 276 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 TUSC2O75896 110 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 HLA-DQB1P01920 261 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 IFNA6P05013 189 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 OR8U9P0C7N5 309 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 PSMB8P28062 276 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 MYCNOSP40205 109 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 RAB25P57735 213 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 AP3S2P59780 193 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 NDPQ00604 133 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 IL18Q14116 193 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 PLGLAQ15195 96 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 LIN54Q6MZP7 749 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 LPCAT3Q6P1A2 487 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 PDPNQ86YL7 162 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 LAX1Q8IWV1 398 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 CMTM1Q8IZ96 169 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF645Q8N7E2 425 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 OR5AN1Q8NGI8 311 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 OR6F1Q8NGZ6 308 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 OR8U1Q8NH10 309 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 GIMAP1Q8WWP7 306 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 DEDD2Q8WXF8 326 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 MAFIPQ8WZ33 124 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 DPF1Q92782 380 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 P2RX4Q99571 388 aa5.99□□□□□ -1.45
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SGMS1-201ENST00000361543 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 AIFM2Q9BRQ8 373 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 OR2D2Q9H210 308 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 FBXL15Q9H469 300 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 EHFQ9NZC4 300 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 RNF150Q9ULK6 438 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 WSB1Q9Y6I7 421 aa5.99□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 M0R1X1 148 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 CTDSP2O14595 271 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 PROP1O75360 226 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 SPDEFO95238 335 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 IGLV1-40P01703 118 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV1-16P04430 117 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 PPIFP30405 207 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 FCGR2CP31995 323 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 ECI1P42126 302 aa5.98□□□□□ -1.45
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