RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 OR52M1Q8NGK5 317 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 LPAR2Q9HBW0 351 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 FOXJ2Q9P0K8 574 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 FUT9Q9Y231 359 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TNFRSF9Q07011 255 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TAL2Q16559 108 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SLC23A3Q6PIS1 610 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM91Q6ZNR0 172 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 PRR18Q8N4B5 295 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 METTL26Q96S19 204 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 LHX9Q9NQ69 397 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 FAHP16930 419 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 COL9A1P20849 921 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 GNB2P62879 340 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF721Q8TF20 911 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 Q96M66 194 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 GPA33Q99795 319 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 DOCK8Q8NF50 2099 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 DUSP2Q05923 314 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OR1B1Q8NGR6 318 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 AHRRA9YTQ3 701 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 EFSO43281 561 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ENSAO43768 121 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 C2orf68Q2NKX9 166 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OR10W1Q8NGF6 305 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SLC50A1Q9BRV3 221 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM14DPA8MWL7 114 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OOSP1A8MZH6 123 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OR9G9P0C7N8 305 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SRD5A1P18405 259 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 PGFP49763 221 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 EDDM3BP56851 147 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TCTN1Q2MV58 587 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SPRED2Q7Z698 418 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 GPR27Q9NS67 375 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 CXCL2P19875 107 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 PRDX2P32119 198 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 C1orf194Q5T5A4 169 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 GUSBP11Q6P575 273 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 LDLRAD3Q86YD5 345 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 NECAP1Q8NC96 275 aa4.24□□□□□ -1.73
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PTPRD-201ENST00000355233 OR8B2Q96RD0 313 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 C10orf91Q5T1B1 145 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TTC9CQ8N5M4 171 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF414Q96IQ9 312 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 DNAJC30Q96LL9 226 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ELOVL5Q9NYP7 299 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 M0R3E3 92 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 KLF4O43474 513 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 WNT2P09544 360 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 CXCL3P19876 107 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 EMDP50402 254 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 GFERP55789 205 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 CCL20P78556 96 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 AESQ08117 197 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM78Q5T7P6 136 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 FNDC7Q5VTL7 733 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 C10orf126Q8N4M7 172 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 FAM222BQ8WU58 562 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1B0GUT8 65 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM189A5PLL7 270 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OR11H12B2RN74 326 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SHISA9B4DS77 424 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 RBP4P02753 201 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ACYP1P07311 99 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 IL11P20809 199 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 PVRIGQ6DKI7 326 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SFTPA2Q8IWL1 248 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 SFTPA1Q8IWL2 248 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OR11H1Q8NG94 326 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OR2K2Q8NGT1 345 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OR11H2Q8NH07 326 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ALG14Q96F25 216 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRD-201ENST00000355233 OR2H1Q9GZK4 316 aa4.24□□□□□ -1.73
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