RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326715.4

VWDE-202, Transcript of von Willebrand factor D and EGF domains, humanhuman

TSL 5

Gene VWDE, Length 1,394 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDE-202ENST00000326715 LFNGQ8NES3 379 aa11.25□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 GRPEL2Q8TAA5 225 aa11.25□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 MYOZ3Q8TDC0 251 aa11.25□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 HARBI1Q96MB7 349 aa11.25□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 DIABLOQ9NR28 239 aa11.25□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 RBBP9O75884 186 aa11.24□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 ELANEP08246 267 aa11.24□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 ARPC4P59998 168 aa11.24□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 SPCS2Q15005 226 aa11.24□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 TMEM177Q53S58 311 aa11.24□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 TMEM69Q5SWH9 247 aa11.24□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 PPP1R27Q86WC6 154 aa11.24□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa11.24□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 ZNF645Q8N7E2 425 aa11.24□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 ZNF491Q8N8L2 437 aa11.24□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 SECTM1Q8WVN6 248 aa11.24□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 MS4A10Q96PG2 267 aa11.24□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 ZFP57Q9NU63 452 aa11.24□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 A0A0A6YYH2 397 aa11.23□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 A6NJ64 397 aa11.23□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 CCL24O00175 119 aa11.23□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 SHOXO15266 292 aa11.23□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 FCGR3BO75015 233 aa11.23□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 PMP2P02689 132 aa11.23□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 RFX2P48378 723 aa11.23□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 RAB25P57735 213 aa11.23□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 FXYD4P59646 89 aa11.23□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 FXYD3Q14802 87 aa11.23□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 C10orf55Q5SWW7 151 aa11.23□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa11.23□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 COMMD1Q8N668 190 aa11.23□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 TAS2R8Q9NYW2 309 aa11.23□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 IGHV3-11P01762 117 aa11.22□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 CTXN2P0C2S0 81 aa11.22□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 OR5H8P0DN80 308 aa11.22□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 MYOD1P15172 320 aa11.22□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 RAB9AP51151 201 aa11.22□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 C19orf35Q6ZS72 473 aa11.22□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 SNX29P2Q8IUI4 249 aa11.22□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 CROCCP3Q8IVE0 287 aa11.22□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 OR5T1Q8NG75 326 aa11.22□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 ARPC1AQ92747 370 aa11.22□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 RNF5Q99942 180 aa11.22□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 ZNF580Q9UK33 172 aa11.22□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 ANAPC10Q9UM13 185 aa11.22□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 I3L521 148 aa11.21□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 PPYP01298 95 aa11.21□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 MYCNOSP40205 109 aa11.21□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 ZNF562Q6V9R5 426 aa11.21□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 KCTD9Q7L273 389 aa11.21□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 LYSMD2Q8IV50 215 aa11.21□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 MIXL1Q9H2W2 232 aa11.21□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
VWDE-202ENST00000326715 RAMP3O60896 148 aa11.2□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 SPDEFO95238 335 aa11.2□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 HLA-DMAP28067 261 aa11.2□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 CDK10Q15131 360 aa11.2□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 RTL8BQ17RB0 113 aa11.2□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 GPR141Q7Z602 305 aa11.2□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 TMEM17Q86X19 198 aa11.2□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 MFSD4AQ8N468 514 aa11.2□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 OR11H1Q8NG94 326 aa11.2□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 OR5AP2Q8NGF4 316 aa11.2□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 C4orf3Q8WVX3 66 aa11.2□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa11.2□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 GON7Q9BXV9 100 aa11.2□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 SLC5A7Q9GZV3 580 aa11.2□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 IFT46Q9NQC8 304 aa11.2□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 EHFQ9NZC4 300 aa11.2□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa11.19□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 E7EUB6 86 aa11.19□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 CNIH1O95406 144 aa11.19□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 NAT1P18440 290 aa11.19□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 RORCP51449 518 aa11.19□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 PRSS8Q16651 343 aa11.19□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 ACTBL2Q562R1 376 aa11.19□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa11.19□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 GPX8Q8TED1 209 aa11.19□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa11.19□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 FXYD6Q9H0Q3 95 aa11.19□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 NECAP2Q9NVZ3 263 aa11.19□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa11.18□□□□□ -0.62
VWDE-202ENST00000326715 A0A087WW49 117 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms