RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 IFNA21P01568 189 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 BRWD1-AS2P59051 145 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 C17orf50Q8WW18 174 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLEKHA2Q9HB19 425 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 YAE1D1Q9NRH1 226 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 MGAT4CQ9UBM8 478 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUP50Q9UKX7 468 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYO9AB2RTY4 2548 aa22.14■■□□□ 1.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 HOXB5P09067 269 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 LHFPL5Q8TAF8 219 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB18Q9NP72 206 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 HMX3A6NHT5 357 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 GOSR2O14653 212 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 S1PR2O95136 353 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 AKR1C2P52895 323 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 FCN2Q15485 313 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC35G3Q8N808 338 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 COMMD9Q9P000 198 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABCA1O95477 2261 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 DBX1A6NMT0 343 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 BRS3P32247 399 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERVK-16P61578 105 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 LYZL2Q7Z4W2 148 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 DYNAPQ8N1N2 210 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 AIFM2Q9BRQ8 373 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM25EA8MYX2 175 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 SHOXO15266 292 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD1BP29016 333 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 KRTAP1-1Q07627 177 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4C13Q8NGP0 309 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMED3Q9Y3Q3 217 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A0U1RQK1 487 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAP1O75689 374 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 HRASP01112 189 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 KRASP01116 189 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGKV1-16P04430 117 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 SULT1A3P0DMM9 295 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 SULT1A4P0DMN0 295 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 NQO2P16083 231 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 PAX6P26367 422 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 R3HDM4Q96D70 268 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 AJUBAQ96IF1 538 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 C5orf51A6NDU8 294 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGKV1-39P01597 117 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGKV1D-39P04432 117 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBP1P09467 338 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAPPC2P0DI81 140 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAPPC2BP0DI82 140 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD99P14209 185 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 VDAC1P21796 283 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPS16P62249 146 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 GSG1LQ6UXU4 331 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 DMBX1Q8NFW5 382 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 HARBI1Q96MB7 349 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCSO14618 274 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 FSHBP01225 129 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 HNF1AP20823 631 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 G6PCP35575 357 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 GGNBP1Q5YKI7 109 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR11H7Q8NGC8 314 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 CFHR4Q92496 578 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 HES1Q14469 280 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 C2orf68Q2NKX9 166 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM177Q53S58 311 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5M8Q8NGP6 311 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDCD10Q9BUL8 212 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 MARCH11A6NNE9 402 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 FOSL1P15407 271 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 HLA-GP17693 338 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 SRP14P37108 136 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM120AOSQ5T036 256 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHAC2Q8WUX2 184 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 MEGF9Q9H1U4 602 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 VENTXO95231 258 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGKV1D-33P01593 117 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGKV1-33P01594 117 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM106CPP0CH98 169 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 CXCL3P19876 107 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 SSX9Q7RTT3 188 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM219AQ8IW50 185 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 SEC22AQ96IW7 307 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 RHOVQ96L33 236 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPIN2AQ99865 258 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMUB1Q9BVT8 246 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 MMP24Q9Y5R2 645 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZANQ9Y493 2812 aa22.06■■□□□ 1.12
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