RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000106653.3

Usp47-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene Usp47, Length 5,540 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47-201ENSMUST00000106653 Gm14851Q5ERJ0 116 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp47-201ENSMUST00000106653 Tmem144Q8VEH0 348 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr1324Q8VEU7 332 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr362Q8VGV7 317 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp47-201ENSMUST00000106653 Ascl3Q9JJR7 174 aa14.72□□□□□ -0.05
Usp47-201ENSMUST00000106653 Trav12-2A0N8N6 114 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp47-201ENSMUST00000106653 Hist1h1aP43275 213 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp47-201ENSMUST00000106653 PjvkQ0ZLH2 352 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp47-201ENSMUST00000106653 MrgprgQ91ZB5 289 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp47-201ENSMUST00000106653 Hoxd9P28357 339 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp47-201ENSMUST00000106653 Fgf7P36363 194 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp47-201ENSMUST00000106653 Shc1P98083 579 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp47-201ENSMUST00000106653 Spem1Q5F289 310 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr1281Q7TQY6 305 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr1462Q8VFW3 307 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp47-201ENSMUST00000106653 Rgs19Q9CX84 216 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp47-201ENSMUST00000106653 Slc46a1Q6PEM8 459 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp47-201ENSMUST00000106653 Rbmxl1Q91VM5 388 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Usp47-201ENSMUST00000106653 Mmp16Q9WTR0 607 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp47-201ENSMUST00000106653 Ccr9Q9WUT7 369 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp47-201ENSMUST00000106653 Ccl8Q9Z121 97 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp47-201ENSMUST00000106653 Brca1P48754 1812 aa14.71□□□□□ -0.05
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr1496B9EHG2 317 aa14.71□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 P01667 111 aa14.71□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Fam210bQ9D8B6 190 aa14.71□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Mdp1Q9D967 164 aa14.71□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr1438-ps1A0A140LHS9 319 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Tpt1P63028 172 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Wbp1lQ8BGW2 348 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Zfp747Q8BHM7 422 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Klre1Q8CJC7 226 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr507Q8VG13 316 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr1242Q8VGM6 306 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 H1fooQ8VIK3 304 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Defb7Q91V70 71 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Mien1Q9CQ86 115 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Plp2Q9R1Q7 152 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Ttc6G3UYY4 1857 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Tmem178bM0QWJ9 172 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Spsb2O88838 264 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Hoxa1P09022 331 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Rasl12Q08AT1 266 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Tnfrsf19Q9JLL3 416 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Kcne4Q9WTW3 170 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Prr23a2D3YWX5 253 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Zfp707F6QUN2 391 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Lsm2O35900 95 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Tff3Q62395 81 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Parp16Q7TMM8 322 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Cysltr2Q920A1 309 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Slc31a2Q9CPU9 143 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr1436A0PK57 315 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr1329L7MTV4 313 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Ctf1Q60753 203 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Slc35e3Q6PGC7 313 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr483Q8VG05 315 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Barx1Q9ER42 254 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Gm29049A0A087WSM5 227 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr1029A2ATE0 324 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Gm4884E9PVP9 694 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Gm10097J3KMK7 105 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Gm21118J3QPK8 227 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Cst7O89098 144 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 P01746 140 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Gm20909Q5FWB5 227 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Gm20852Q5M8R5 227 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Gm20917Q62457 227 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Gm20809Q62458 227 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Gm20865Q62460 227 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr1371Q7TQT7 311 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr1028Q7TR89 324 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Gm20738Q810R8 227 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Gm20806Q9D9T3 227 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Insl6Q9QY05 191 aa14.7□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Scn5aQ9JJV9 2019 aa14.69□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Rps4xP62702 263 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Nudt9Q8BVU5 350 aa14.69□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr1450Q8VF19 325 aa14.69□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr214Q8VG27 320 aa14.69□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Wdr20Q9D5R2 567 aa14.69□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Tspan32Q9JHH2 256 aa14.69□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr963Q7TRA9 311 aa14.69□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Q8C3M9 231 aa14.69□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 GmppaQ922H4 420 aa14.69□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr157Q9QZ20 318 aa14.69□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Vmn1r61W4VSP5 300 aa14.69□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Tnfrsf17O88472 185 aa14.69□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Thsd4Q3UTY6 1018 aa14.69□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Tmprss2Q9JIQ8 490 aa14.69□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 CroccQ8CJ40 2009 aa14.69□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 A0A286YDM5 308 aa14.69□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr1154L7MU57 310 aa14.69□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Sub1P11031 127 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 TspoP50637 169 aa14.69□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 SergefQ80YD6 464 aa14.69□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Mrpl42Q9CPV3 142 aa14.69□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Rab32Q9CZE3 223 aa14.69□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Ier2P17950 221 aa14.68□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr1170Q8VFG1 316 aa14.68□□□□□ -0.06
Usp47-201ENSMUST00000106653 Olfr992Q8VGC6 309 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 52.4 ms