RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000032487.13

Vamp1-201, Transcript of Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vamp1, Length 2,772 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zfp819Q80V81 607 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Znf775Q8BI73 538 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Lhfpl6Q8BM86 200 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pias2Q8C5D8 621 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 RydenQ8CAK3 290 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 TskuQ8CBR6 354 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mfsd4b1Q8VCV9 425 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr1427Q8VFU9 311 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr559Q8VH14 318 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cysltr2Q920A1 309 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ms4a3Q920C4 213 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mid1ip1Q9CQ20 182 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tmem42Q9CR22 157 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 ChtopQ9CY57 249 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Lamtor5Q9D1L9 91 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Il36bQ9D6Z6 183 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Fgf21Q9JJN1 210 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 P2ry4Q9JJS7 361 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Golga4Q91VW5 2238 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm28285A0A087WQ54 102 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Igkv6-29A0A0G2JEI6 115 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr920E9Q413 310 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm10638F6QEG2 257 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm10428J3QNV7 132 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm15292L7N231 93 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 GamtO35969 236 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 CtrcQ3SYP2 268 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Spc25Q3UA16 226 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr16Q62007 309 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Il11ra1Q64385 432 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Morn2Q6UL01 79 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rspo2Q8BFU0 243 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Actrt3Q8BXF8 369 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Defb21Q8C5Z4 100 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Nfatc4Q8K120 901 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr870Q8VGG4 311 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr354Q8VGJ8 317 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Q91WE4 72 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Klf7Q99JB0 301 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rnase6Q9D244 153 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Nudt3Q9JI46 168 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Dapp1Q9QXT1 280 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Nprl2Q9WUE4 380 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Snrnp200Q6P4T2 2136 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Col27a1Q5QNQ9 1845 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ighv8-2A0A0A6YW58 119 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm21103E9Q2Q1 267 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr889L7N1Y6 314 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Vmn1r169L7N275 304 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 AF067061O70616 171 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Il2raP01590 268 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Il4P07750 140 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Hnrnpa1P49312 320 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Efnb2P52800 336 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Lefty2P57785 368 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pdlim4P70271 330 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ikzf2P81183 526 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rasl10bQ5SSG5 203 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Csnk2a1Q60737 391 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm5148Q8BGG2 154 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tm2d3Q8BJ83 261 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Csnk1a1Q8BK63 337 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr1440Q8VFV4 315 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rpp25Q91WE3 199 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 2210010C04RikQ9CPN9 247 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cdca4Q9CWM2 237 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Med29Q9DB91 199 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mageh1Q9NWG9 218 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Srsf10Q9R0U0 262 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Kcne3Q9WTW2 103 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm26992S4R1A3 76 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Exph5Q0VAV2 1960 aa10.14□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Heatr5aQ5PRF0 2038 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zfp873A0A1B0GT64 667 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Trav12-2A0N8N6 114 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc35d1A2AKQ0 355 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Eid2bE9Q2Y0 151 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Vmn1r160E9Q346 307 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Vmn1r123L7N270 307 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Dbil5O09035 87 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr1537P34983 314 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ear2P97425 156 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr733Q14AK5 308 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Trp53i11Q4QQM4 189 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Fa2hQ5MPP0 372 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Shc4Q6S5L9 626 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr1246Q7TQZ6 314 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr1000Q7TR99 314 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr967Q7TRA6 310 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pced1bQ8BGX1 433 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mboat1Q8BH98 492 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm10600Q8BQ57 223 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cphx2Q8BX39 182 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Vmn1r70Q8R254 298 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Vmn1r19Q8R2C7 308 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr974Q8VH09 310 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Chrm5Q920H4 532 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Q99K99 313 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rab27bQ99P58 218 aa10.13□□□□□ -0.79
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tmem50bQ9D1X9 158 aa10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.2 ms