RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	OR5T1	Q8NG75	326 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	RHOV	Q96L33	236 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	HARBI1	Q96MB7	349 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM68	Q96MH6	324 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	RDH8	Q9NYR8	311 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		11.31	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A0A6YYD4	124 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	BET1	O15155	118 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	SHOX	O15266	292 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	AADAC	P22760	399 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	PSMD7	P51665	324 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF383	Q8NA42	475 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	PTX4	Q96A99	478 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	GINS4	Q9BRT9	223 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	PECR	Q9BY49	303 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	OR2D2	Q9H210	308 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	TUBA4B	Q9H853	241 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	COA4	Q9NYJ1	87 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A0B4J203	849 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	GADD45A	P24522	165 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	QRFP	P83859	136 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	FABP7	O15540	132 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	ACTL6B	O94805	426 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	IFNA6	P05013	189 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	RRAS	P10301	218 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	TALDO1	P37837	337 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	CLDN12	P56749	244 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	RPEL1	Q2QD12	228 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	LCN12	Q6JVE5	192 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	RAB3C	Q96E17	227 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	CITED4	Q96RK1	184 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	SPATA25	Q9BR10	227 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599	CENPO	Q9BU64	300 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599		V9GY05	133 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A075B6Q4	140 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	PDCD5	O14737	125 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	RGS10	O43665	173 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	IGLV1-51	P01701	117 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	SYNJ2BP	P57105	145 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	TPBG	Q13641	420 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	USMG5	Q96IX5	58 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	PEMT	Q9UBM1	199 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	RAB22A	Q9UL26	194 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	MYL9	P24844	172 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	ARFRP1	Q13795	201 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	TNXA	Q16473	311 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	HES5	Q5TA89	166 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599		Q8N402	240 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	BVES	Q8NE79	360 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		11.26	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	TUSC2	O75896	110 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	FCGR3A	P08637	254 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	APELA	P0DMC3	54 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM50B	P56557	158 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	LINC00205	P59089	165 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	SNAPC3	Q92966	411 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		11.25	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599		A8MZ25	164 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	DEFA5	Q01523	94 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	IGSF11	Q5DX21	431 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		11.24	□□□□□ -0.61
TARDBP-231	ENST00000639599	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		11.24	□□□□□ -0.61

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