RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638481.1

SPIN3-208, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,050 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-208	ENST00000638481	IL19	Q9UHD0	177 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	COL12A1	Q99715	3063 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481		A0A087WWC5	75 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	GPR37	O15354	613 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	HAND1	O96004	215 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	TFF1	P04155	84 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	HOXA5	P20719	270 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	GATA4	P43694	442 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	RARRES2	Q99969	163 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	C17orf100	A8MU93	164 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	SRRM5	B3KS81	715 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	HSD17B6	O14756	317 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	TXNL1	O43396	289 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	CCL8	P80075	99 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	TLE4	Q04727	773 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	ATP5S	Q99766	215 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	GCM1	Q9NP62	436 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	VSTM5	A8MXK1	200 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	SH2D1B	O14796	132 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	DFFB	O76075	338 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	TNFSF4	P23510	183 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	CFHR2	P36980	270 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	OR2B8P	P59922	312 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	CCL20	P78556	96 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	HERPUD1	Q15011	391 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	TREM2	Q9NZC2	230 aa		12.46	□□□□□ -0.41
SPIN3-208	ENST00000638481	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		12.46	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	PSPN	O60542	156 aa		12.46	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC25A6	P12236	298 aa		12.46	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		12.46	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	STX12	Q86Y82	276 aa		12.46	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		12.46	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		12.46	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481		H3BQ15	152 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	CHST1	O43916	411 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	CST7	O76096	145 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	ADH4	P08319	380 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	CHD6	Q8TD26	2715 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481		A0A1B0GU03	582 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	C19orf84	I3L1E1	186 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	LHB	P01229	141 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	IFNA5	P01569	189 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	CD55	P08174	381 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	TAS2R30	P59541	319 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	UBE2K	P61086	200 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	HAGH	Q16775	308 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	FAM201A	Q5SY85	155 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF843	Q8N446	348 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	RAB39B	Q96DA2	213 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	GGACT	Q9BVM4	153 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	METRN	Q9UJH8	293 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	RFNG	Q9Y644	331 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM50A	O95807	157 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	WNT2	P09544	360 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	F2R	P25116	425 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	ICAM4	Q14773	271 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	EFNB3	Q15768	340 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF429	Q86V71	674 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	TVP23C	Q96ET8	276 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	RAB40C	Q96S21	281 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	DIRC2	Q96SL1	478 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-208	ENST00000638481	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		12.44	□□□□□ -0.42

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