RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		13.01	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		13.01	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		13.01	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035		G3V318	75 aa		13	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC22A5	O76082	557 aa		13	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPDEF	O95238	335 aa		13	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGKV1-16	P04430	117 aa		13	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGLL1	P15814	213 aa		13	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	LGALS7	P47929	136 aa		13	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	CX3CL1	P78423	397 aa		13	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	PSG5	Q15238	335 aa		13	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		13	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		13	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		13	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		13	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		12.99	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	SHOX	O15266	292 aa		12.99	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	SSX5	O60225	188 aa		12.99	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	CD40LG	P29965	261 aa		12.99	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	ECSCR	Q19T08	205 aa		12.99	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		12.99	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		12.99	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		12.99	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		12.99	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	BVES	Q8NE79	360 aa		12.99	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	BEST4	Q8NFU0	473 aa		12.99	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		12.99	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A1W2PN81	502 aa		12.98	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	FCN1	O00602	326 aa		12.98	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	XRCC3	O43542	346 aa		12.98	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC25A17	O43808	307 aa		12.98	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	CNIH1	O95406	144 aa		12.98	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	PSMB8	P28062	276 aa		12.98	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHRNA7	P36544	502 aa		12.98	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	CBX5	P45973	191 aa		12.98	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAB25	P57735	213 aa		12.98	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	CFHR3	Q02985	330 aa		12.98	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		12.98	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		12.98	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		12.98	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		12.98	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	RNF152	Q8N8N0	203 aa		12.98	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	HARBI1	Q96MB7	349 aa		12.98	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		12.98	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		12.98	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLXNB1	O43157	2135 aa		12.98	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		12.98	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		12.97	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCL24	O00175	119 aa		12.97	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	TUSC2	O75896	110 aa		12.97	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	CA2	P00918	260 aa		12.97	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	HLA-DQB1	P01920	261 aa		12.97	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	VBP1	P61758	197 aa		12.97	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	NCS1	P62166	190 aa		12.97	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		12.97	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		12.97	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	REC114	Q7Z4M0	266 aa		12.97	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	HOGA1	Q86XE5	327 aa		12.97	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		12.97	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		12.97	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	DPF1	Q92782	380 aa		12.97	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		12.97	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	IFT46	Q9NQC8	304 aa		12.97	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		12.97	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		12.97	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	FCER2	P06734	321 aa		12.96	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAB9A	P51151	201 aa		12.96	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	GNB1	P62873	340 aa		12.96	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	FXYD3	Q14802	87 aa		12.96	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		12.96	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		12.96	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		12.96	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	DUX3	Q96PT4	197 aa		12.96	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		12.96	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	VSIG4	Q9Y279	399 aa		12.96	□□□□□ -0.33
JMJD1C-211	ENST00000633035	CRYZL1	O95825	349 aa		12.95	□□□□□ -0.34
JMJD1C-211	ENST00000633035	IGLV1-40	P01703	118 aa		12.95	□□□□□ -0.34
JMJD1C-211	ENST00000633035	FCGR2C	P31995	323 aa		12.95	□□□□□ -0.34
JMJD1C-211	ENST00000633035	RORC	P51449	518 aa		12.95	□□□□□ -0.34
JMJD1C-211	ENST00000633035	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		12.95	□□□□□ -0.34
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM177	Q53S58	311 aa		12.95	□□□□□ -0.34
JMJD1C-211	ENST00000633035	ACTBL2	Q562R1	376 aa		12.95	□□□□□ -0.34
JMJD1C-211	ENST00000633035	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		12.95	□□□□□ -0.34
JMJD1C-211	ENST00000633035	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		12.95	□□□□□ -0.34
JMJD1C-211	ENST00000633035	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		12.95	□□□□□ -0.34
JMJD1C-211	ENST00000633035	LFNG	Q8NES3	379 aa		12.95	□□□□□ -0.34
JMJD1C-211	ENST00000633035	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		12.95	□□□□□ -0.34
JMJD1C-211	ENST00000633035	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		12.95	□□□□□ -0.34

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