RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		10.71	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		10.71	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		10.71	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		10.71	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		10.71	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		10.71	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	GHITM	Q9H3K2	345 aa		10.71	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		10.71	□□□□□ -0.69
MUC1-222	ENST00000610468	RAB27B	O00194	218 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	PDCD5	O14737	125 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	RBBP9	O75884	186 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	MYL9	P24844	172 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	MC5R	P33032	325 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	PTX4	Q96A99	478 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	RNF5	Q99942	180 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	10.7	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		10.7	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	SORL1	Q92673	2214 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	ACTBL2	Q562R1	376 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	RHOV	Q96L33	236 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	CITED4	Q96RK1	184 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	RNF150	Q9ULK6	438 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	GAB2	Q9UQC2	676 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		10.69	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468		A8MZ25	164 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	PROP1	O75360	226 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	LYL1	P12980	280 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	RAB6A	P20340	208 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	VBP1	P61758	197 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	PITPNA	Q00169	270 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	MXD1	Q05195	221 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	PLGLA	Q15195	96 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	ZMAT4	Q9H898	229 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	RAB22A	Q9UL26	194 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	HSF4	Q9ULV5	492 aa		10.68	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	HSPA12A	O43301	675 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	SPDEF	O95238	335 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	IGLV1-51	P01701	117 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	IGHV3-11	P01762	117 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	PSG5	Q15238	335 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	GPR107	Q5VW38	600 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468		Q8N1Y9	231 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	LFNG	Q8NES3	379 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	OR4C12	Q96R67	309 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		10.67	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	LCE6A	A0A183	80 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468		H7C2Y5	167 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	MFNG	O00587	321 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	CA2	P00918	260 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	IGKV1-16	P04430	117 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	ZBTB25	P24278	435 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	TPPP2	P59282	170 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	MS4A10	Q96PG2	267 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	PECR	Q9BY49	303 aa		10.66	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
MUC1-222	ENST00000610468	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		10.66	□□□□□ -0.7

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