RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597782.5

TIMM50-210, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 5

Gene TIMM50, Length 456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-210ENST00000597782 SSR3Q9UNL2 185 aa13.04□□□□□ -0.32
TIMM50-210ENST00000597782 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
TIMM50-210ENST00000597782 COL7A1Q02388 2944 aa13.04□□□□□ -0.32
TIMM50-210ENST00000597782 FCN1O00602 326 aa13.03□□□□□ -0.32
TIMM50-210ENST00000597782 PROP1O75360 226 aa13.03□□□□□ -0.32
TIMM50-210ENST00000597782 CA2P00918 260 aa13.03□□□□□ -0.32
TIMM50-210ENST00000597782 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
TIMM50-210ENST00000597782 ZNF260Q3ZCT1 412 aa13.03□□□□□ -0.32
TIMM50-210ENST00000597782 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
TIMM50-210ENST00000597782 PDPNQ86YL7 162 aa13.03□□□□□ -0.32
TIMM50-210ENST00000597782 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
TIMM50-210ENST00000597782 OR11H1Q8NG94 326 aa13.03□□□□□ -0.32
TIMM50-210ENST00000597782 MYOZ3Q8TDC0 251 aa13.03□□□□□ -0.32
TIMM50-210ENST00000597782 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TIMM50-210ENST00000597782 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TIMM50-210ENST00000597782 OR51E2Q9H255 320 aa13.03□□□□□ -0.32
TIMM50-210ENST00000597782 TPSG1Q9NRR2 321 aa13.03□□□□□ -0.32
TIMM50-210ENST00000597782 SLC35D1Q9NTN3 355 aa13.03□□□□□ -0.32
TIMM50-210ENST00000597782 GAB2Q9UQC2 676 aa13.03□□□□□ -0.32
TIMM50-210ENST00000597782 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
TIMM50-210ENST00000597782 VSIG4Q9Y279 399 aa13.03□□□□□ -0.32
TIMM50-210ENST00000597782 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TIMM50-210ENST00000597782 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa13.02□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 SLC25A17O43808 307 aa13.02□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 IGLV1-40P01703 118 aa13.02□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 OR8U8P0C7N1 319 aa13.02□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 RAB9AP51151 201 aa13.02□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 MXD1Q05195 221 aa13.02□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 PSG5Q15238 335 aa13.02□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 NEDD8Q15843 81 aa13.02□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 SFXN4Q6P4A7 337 aa13.02□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 ZNF491Q8N8L2 437 aa13.02□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 LGALS14Q8TCE9 139 aa13.02□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 UBE2E2Q96LR5 201 aa13.02□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 SDHAF2Q9NX18 166 aa13.02□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa13.01□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 SPDEFO95238 335 aa13.01□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 INSL3P51460 131 aa13.01□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 GNB1P62873 340 aa13.01□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 CBX3Q13185 183 aa13.01□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 FHL3Q13643 280 aa13.01□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa13.01□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 PPP1R27Q86WC6 154 aa13.01□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 MINDY2Q8NBR6 621 aa13.01□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 GRPEL2Q8TAA5 225 aa13.01□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 C5orf30Q96GV9 206 aa13.01□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 RNF5Q99942 180 aa13.01□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 TOLLIPQ9H0E2 274 aa13.01□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa13□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 I3L521 148 aa13□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 SOX15O60248 233 aa13□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 SDC2P34741 201 aa13□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 ZNF616Q08AN1 781 aa13□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 ARL6IP1Q15041 203 aa13□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 CDNFQ49AH0 187 aa13□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 ACTBL2Q562R1 376 aa13□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 C19orf54Q5BKX5 351 aa13□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 TPRA1Q86W33 373 aa13□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa13□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 OR1N2Q8NGR9 330 aa13□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa13□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 ARPC1AQ92747 370 aa13□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 HARBI1Q96MB7 349 aa13□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 ASCL2Q99929 193 aa13□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa13□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 RNF167Q9H6Y7 350 aa13□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 TMEM235A6NFC5 223 aa12.99□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 C3orf84H3BNL1 204 aa12.99□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 J3QRK9 145 aa12.99□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 DIRAS3O95661 229 aa12.99□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 CLEC2LP0C7M8 214 aa12.99□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 DTYMKP23919 212 aa12.99□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 GNG2P59768 71 aa12.99□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 ASPHD1Q5U4P2 390 aa12.99□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 LFNGQ8NES3 379 aa12.99□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa12.99□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 DNAH9Q9NYC9 4486 aa12.99□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 SHOXO15266 292 aa12.98□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 SCGNO76038 276 aa12.98□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 CNIH1O95406 144 aa12.98□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 IGHV3-11P01762 117 aa12.98□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 CD36P16671 472 aa12.98□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 TPPP2P59282 170 aa12.98□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 FXYD3Q14802 87 aa12.98□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 RTL8BQ17RB0 113 aa12.98□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 HACD4Q5VWC8 232 aa12.98□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 PYHIN1Q6K0P9 492 aa12.98□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 ZNF562Q6V9R5 426 aa12.98□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 BVESQ8NE79 360 aa12.98□□□□□ -0.33
TIMM50-210ENST00000597782 MS4A10Q96PG2 267 aa12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 548.5 ms