RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADTRPQ96IZ2 230 aa26.39■■□□□ 1.82
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MMP24Q9Y5R2 645 aa26.39■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 H7C2Y5 167 aa26.39■■□□□ 1.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 M0QYG6 137 aa26.39■■□□□ 1.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 APOA2P02652 100 aa26.39■■□□□ 1.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSF1P09603 554 aa26.39■■□□□ 1.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 MDKP21741 143 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC5A7Q9GZV3 580 aa26.39■■□□□ 1.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD74P04233 296 aa26.38■■□□□ 1.81
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CTDNEP1-209ENST00000574205 AMY2AP04746 511 aa26.38■■□□□ 1.81
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C5orf56Q8N8D9 126 aa26.38■■□□□ 1.81
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CTDNEP1-209ENST00000574205 STEAP1BQ6NZ63 245 aa26.37■■□□□ 1.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDPNQ86YL7 162 aa26.37■■□□□ 1.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q8N2B8 174 aa26.37■■□□□ 1.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARRDC1Q8N5I2 433 aa26.37■■□□□ 1.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF702PQ9H963 129 aa26.37■■□□□ 1.81
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2T6Q8NHC8 308 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 BORCS5Q969J3 196 aa26.36■■□□□ 1.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC35D1Q9NTN3 355 aa26.36■■□□□ 1.81
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB3DO95716 219 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 F2RL1P55085 397 aa26.34■■□□□ 1.81
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DDB2Q92466 427 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF5Q99942 180 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 STAB1Q9NY15 2570 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV1-16P04430 117 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q8N9W7 124 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4D10Q8NGI6 311 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 RITA1Q96K30 269 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF114Q9Y508 228 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa26.33■■□□□ 1.81
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FXYD6Q9H0Q3 95 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1-209ENST00000574205 AKAIN1P0CW23 69 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 RRASP10301 218 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 GNRHRP30968 328 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 CBX3Q13185 183 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 C12orf54Q6X4T0 127 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q6ZS46 218 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 SRRQ9GZT4 340 aa26.32■■□□□ 1.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 TENM1Q9UKZ4 2725 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00299Q6ZSB3 139 aa26.31■■□□□ 1.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NPBQ8NG41 125 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM63Q969Q1 353 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 NBR2O15453 112 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNTFRP26992 372 aa26.3■■□□□ 1.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 LPCAT3Q6P1A2 487 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 RASL11BQ9BPW5 248 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTTG2Q9NZH5 202 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 SIGLEC9Q9Y336 463 aa26.3■■□□□ 1.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MFSD4AQ8N468 514 aa26.29■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPATA3Q8NHX4 192 aa26.29■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA1456Q9P272 454 aa26.29■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNFSF12O43508 249 aa26.29■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFA3O95167 84 aa26.29■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 UCP3P55916 312 aa26.29■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4C16Q8NGL9 310 aa26.29■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa26.29■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 PROK1P58294 105 aa26.28■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPS16P62249 146 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF45Q02386 682 aa26.28■■□□□ 1.8
CTDNEP1-209ENST00000574205 C9orf152Q5JTZ5 239 aa26.28■■□□□ 1.8
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