RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 OR5H8P0DN80 308 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM3-215ENST00000568477 MYCNOSP40205 109 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM3-215ENST00000568477 TMEM50BP56557 158 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM3-215ENST00000568477 ASAH1Q13510 395 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM3-215ENST00000568477 C2orf76Q3KRA6 126 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM3-215ENST00000568477 HACD4Q5VWC8 232 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM3-215ENST00000568477 C15orf40Q8WUR7 153 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM3-215ENST00000568477 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CMTM3-215ENST00000568477 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CMTM3-215ENST00000568477 PECRQ9BY49 303 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM3-215ENST00000568477 Q9N2K0 584 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF580Q9UK33 172 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM3-215ENST00000568477 DNAH3Q8TD57 4116 aa11.34□□□□□ -0.59
CMTM3-215ENST00000568477 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 ITGB1BP1O14713 200 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 LDLRAD4O15165 306 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 NBR2O15453 112 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 IGF1P05019 195 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 ZBTB25P24278 435 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 RPL39P5Q59GN2 51 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 TRIQKQ629K1 86 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 RNF152Q8N8N0 203 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 EDARADDQ8WWZ3 215 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 DPF1Q92782 380 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 SLC25A38Q96DW6 304 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 GHITMQ9H3K2 345 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 OR1A1Q9P1Q5 309 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 KIAA1456Q9P272 454 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 RAB22AQ9UL26 194 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 TBC1D24Q9ULP9 559 aa11.33□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 IGHG4P01861 327 aa11.32□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 HLA-DRB1P01911 266 aa11.32□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 SCTP09683 121 aa11.32□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 CNTFRP26992 372 aa11.32□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 CEACAM6P40199 344 aa11.32□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 CFHR3Q02985 330 aa11.32□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 C5orf64Q2M2E5 130 aa11.32□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 PLAC9Q5JTB6 97 aa11.32□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 LCNL1Q6ZST4 164 aa11.32□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 PTX4Q96A99 478 aa11.32□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 RAB3CQ96E17 227 aa11.32□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 ABHD14BQ96IU4 210 aa11.32□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 RITA1Q96K30 269 aa11.32□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 ABHD1Q96SE0 405 aa11.32□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 P2RX4Q99571 388 aa11.32□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 RHBDL2Q9NX52 303 aa11.32□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 OR5H14A6NHG9 310 aa11.31□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 CD3GP09693 182 aa11.31□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 MC5RP33032 325 aa11.31□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 PLA2G7Q13093 441 aa11.31□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 NPBQ8NG41 125 aa11.31□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 RAX2Q96IS3 184 aa11.31□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 DUX3Q96PT4 197 aa11.31□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 OR51J1Q9H342 316 aa11.31□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 PARP11Q9NR21 331 aa11.31□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa11.3□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 TRDCB7Z8K6 153 aa11.3□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 H0YJW9 148 aa11.3□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 H7C2Y5 167 aa11.3□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 CCL24O00175 119 aa11.3□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 ATP6V0E1O15342 81 aa11.3□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 RBBP9O75884 186 aa11.3□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 NDUFA3O95167 84 aa11.3□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 CT45A6P0DMU7 189 aa11.3□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 CT45A5P0DMU8 189 aa11.3□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 CT45A7P0DMV0 189 aa11.3□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 RAB6AP20340 208 aa11.3□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 PSMB8P28062 276 aa11.3□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 INPP1P49441 399 aa11.3□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 LIN54Q6MZP7 749 aa11.3□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 MZT2BQ6NZ67 158 aa11.3□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 OR4A4PQ8NGN8 299 aa11.3□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 OR8U1Q8NH10 309 aa11.3□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 AGMATQ9BSE5 352 aa11.3□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 DIABLOQ9NR28 239 aa11.3□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF221Q9UK13 617 aa11.3□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 WASHC3Q9Y3C0 194 aa11.3□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 WSB1Q9Y6I7 421 aa11.3□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 A0A0A6YYH2 397 aa11.29□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 TRAV41A0A0B4J266 112 aa11.29□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa11.29□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 A6NJ64 397 aa11.29□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 RRHO14718 337 aa11.29□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 PLA2G10O15496 165 aa11.29□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 FABP7O15540 132 aa11.29□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 XRCC3O43542 346 aa11.29□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 RAB25P57735 213 aa11.29□□□□□ -0.6
CMTM3-215ENST00000568477 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms